CTD-ILD 支气管肺泡灌洗液与血液单细胞转录组数据集
该数据集为 CTD-ILD 支气管肺泡灌洗液与血液单细胞转录组数据,来源于 omicsdi.org,包含 30 例结缔组织病相关间质性肺病(CTD-ILD)患者和 12 例特发性间质性肺炎(IIP)患者的支气管肺泡灌洗液(BALF)与血液样本的单细胞转录组数据

基本信息
资源简介
CTD-ILD 支气管肺泡灌洗液与血液单细胞转录组数据集
该数据集为 CTD-ILD 支气管肺泡灌洗液与血液单细胞转录组数据,来源于 omicsdi.org,包含 30 例结缔组织病相关间质性肺病(CTD-ILD)患者和 12 例特发性间质性肺炎(IIP)患者的支气管肺泡灌洗液(BALF)与血液样本的单细胞转录组数据。数据集英文名称为 2a8d9e3c-3a68-4472-b4b7-40985237aca5 - samples,在本站归入呼吸系统疾病 / 肺炎分类,主题标签为 Genomics。该数据集将间质性肺病这一组异质性较强的弥漫性肺疾病与单细胞转录组技术结合,为在细胞分辨率上观察肺部局部微环境与外周血免疫状态提供了数据基础。
【数据集背景】
间质性肺病是一组以肺间质炎症和纤维化改变为主要特征的疾病总称,其中结缔组织病相关间质性肺病(CTD-ILD)与特发性间质性肺炎(IIP)是临床中需要鉴别与长期管理的重要类型。支气管肺泡灌洗液(BALF)反映肺部局部的细胞组成与免疫微环境,外周血则反映全身性免疫与炎症状态,两者配对分析有助于理解肺部病变与外周免疫之间的关联。单细胞转录组技术能够在单个细胞层面刻画细胞类型构成与基因表达异质性,为该类疾病的研究提供高分辨率视角。该数据集正是在这一背景下构建的 CTD-ILD 与 IIP 患者的 BALF 与血液单细胞转录组数据集合。
【数据内容】
该数据集由单细胞转录组数据构成,样本类型包括支气管肺泡灌洗液(BALF)与血液两类,来源人群为 30 例结缔组织病相关间质性肺病(CTD-ILD)患者和 12 例特发性间质性肺炎(IIP)患者。数据覆盖肺部局部样本与外周血样本,可用于比较不同疾病类型、不同样本来源之间的细胞组成与转录表达特征。数据集在本站归入呼吸系统疾病 / 肺炎分类,主题标签为 Genomics。除上述样本类型、疾病分组与样本数量外,源站未提供更细的细胞类型注释、测序平台、基因数量等具体信息。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,其内容为来源于 CTD-ILD 与 IIP 患者的支气管肺泡灌洗液与血液样本的单细胞转录组数据。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、测序平台与建库方法等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病特别是间质性肺病方向的研究场景,例如在单细胞层面比较 CTD-ILD 与 IIP 患者 BALF 与血液样本的细胞组成差异,探索肺部局部免疫微环境与外周血免疫状态之间的关系,或作为间质性肺病单细胞转录组研究的参考数据。其主题标签为 Genomics,也可用于基因组学相关分析方法的应用与验证。具体分析用途需结合源站提供的原始信息与数据本身判断,源站未提供明确的推荐应用列表。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法、数据格式、下载方式与处理流程说明。使用者应参照 omicsdi.org 上该数据集的原始条目获取数据与相关说明。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息、批次信息、数据完整性说明或已知限制。需要说明的是,该数据集样本来自 CTD-ILD 与 IIP 两类患者,样本量为 30 例与 12 例,使用时应结合具体研究问题考虑样本构成与分组情况。除此之外,源站未提供其他质量与限制相关信息。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用时应查阅 omicsdi.org 上该数据集原始条目所附的引用与许可说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001011334
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
CTD-ILD BALF和血液scRNA-seq数据集包含来自30例结缔组织病相关间质性肺病(CTD-ILD)和12例特发性间质性肺炎(IIP)患者的支气管肺泡灌洗液(BALF)和血液的单细胞转录组数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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