分枝杆菌同源数据库(75%同源性阈值)

该数据集以表格形式呈现了九种分枝杆菌物种的注释蛋白质序列比对结果,包含氨基酸同源性大于75%的蛋白质匹配信息,数据模态为结构化表格。其主要用途是支持微生物蛋白质同源性比较和跨物种功能保守性分析,为研究分枝杆菌的进化关系、功能注释及感染相关机制提供数据基础。

Figshare
2019-02-12 更新
浏览 31
gene ontologymycobacteriahomologous protein
Mycobacterial Homology Database with 75% Identity Cutoff

基本信息

大小
0.002304006 GB
许可
CC0
创建/更新时间
2019-02-12
版本
v1

资源简介

分枝杆菌同源数据库(75%同源性阈值)

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Mycobacterial Homology Database with 75% Identity Cutoff》。源站首次发布:2019-02-12。

【数据内容】

源站原始描述:This is a table of results from comparison of the annotated proteins from nine different mycobacterial species. The goal of its creation was to suggest which proteins are likely to have identical functions between species. This table reports only those protein comparisons with greater than 75% amino acid identity. Each row is a different gene used to search for close matches, each column is the genome used for searching. In parentheses next to the name of each match is the percent identity betwe…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 2.30 MB。Supp_File_5-mhdb_75.xlsx:application/zip,2.30 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.6969899.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Microbiology、Genomics、Bioinformatics、Bacteriology。主题标签:gene ontology、mycobacteria、homologous protein。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Microbiology、Genomics、Bioinformatics、Bacteriology。

【获取与许可】

源站页面:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Mycobacterial_Homology_Database_with_75_Identity_Cutoff/6969899

使用许可:CC0(https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/)。

规范引用:Matern, William M.; Bader, Joel S.; Karakousis, Petros C. (2019). Mycobacterial Homology Database with 75% Identity Cutoff. figshare. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-02,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

源站:https://springernature.figshare.com/articles/Mycobacterial_Homology_Database_with_75_Identity_Cutoff/6969899/1

按页面 Download 按钮获取。

数据说明

该数据集是一个表格,记录了九种不同分枝杆菌物种的注释蛋白质之间的比对结果。其构建目的是为了推断不同物种间可能具有相同功能的蛋白质。该表格仅报告氨基酸序列同源性大于75%的蛋白质比对结果。每一行代表一个用于搜索高度匹配基因的查询基因,每一列代表用于搜索的基因组。每个匹配项名称旁括号内标注了查询序列与匹配序列之间的同源性百分比。数据来源于对九种分枝杆菌物种的蛋白质序列进行系统比对分析,主要应用于微生物蛋白质同源比较、跨物种功能保守性分析以及分枝杆菌感染机制的相关研究。

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