间皮瘤基因组与临床研究数据库
cBioPortal 间皮瘤数据集基于 TCGA 数据构建,整合基因突变、表达谱与临床生存信息,支持交互式分析与癌症基因组学研究,是研究间皮瘤分子机制的重要平台数据资源。

基本信息
资源简介
间皮瘤基因组与临床研究数据库
【一句话概览】
TCGA间皮瘤(Mesothelioma)数据集,来源为GDAC Firehose,此前称为TCGA Provisional,标签为plmeso(来源 cBioPortal)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Mesothelioma (TCGA, Firehose Legacy)》。
【数据内容】
源站原始描述:TCGA Mesothelioma. Source data from GDAC Firehose . Previously known as TCGA Provisional
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):TCGA间皮瘤。数据来源于GDAC Firehose。此前称为TCGA临时版。
【主题与分类】
主题标签:plmeso。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=meso_tcga
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=meso_tcga
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
cBioPortal 提供的 TCGA 间皮瘤研究数据集整合了基因突变、表达谱、拷贝数变化及临床生存信息,支持可视化分析与癌症基因组学研究。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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