肺鳞癌基因组数据库
TCGA-LUSC 是肺鳞状细胞癌多组学数据集，包含基因表达、突变信息及临床数据，广泛用于肺癌分型、预后分析及分子机制研究。
基本信息
资源简介
肺鳞癌基因组数据库
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Lung Squamous Cell Carcinoma》。
【数据内容】
源站原始描述：disease_type: Adenomas and Adenocarcinomas, Squamous Cell Neoplasms；primary_site: Bronchus and lung；data categories: Simple Nucleotide Variation, Sequencing Reads, Biospecimen, Clinical, Copy Number Variation, Transcriptome Profiling, DNA Methylation, Proteome Profiling, Somatic Structural Variation, Structural Variation；Lung Squamous Cell Carcinoma；TCGA-LUSC
【主题与分类】
主题标签：[''Adenomas and Adenocarcinomas'', ''Squamous Cell Neoplasms'']、[''Bronchus and lung'']。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-LUSC
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-LUSC
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
TCGA-LUSC 提供肺鳞状细胞癌的多组学数据，包括基因表达谱、突变信息及临床数据，用于癌症机制与预后研究。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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