烟曲霉Af293温度转换后的转录谱分析
该数据集来自 omicsdi.org，属于呼吸道疾病/真菌性肺部感染分类，主题为 Transcriptomics。研究对烟曲霉 Af293 在 30C 萌发后转移至 37C 或 48C 继续培养，并在温度转换后 0、15、30、60、120、180 分钟取样，进行转录谱分析
基本信息
资源简介
烟曲霉Af293温度转换后的转录谱分析
该数据集名为“Transcription profiling of Aspergillus fumigatus Af293 after temperature shifting”，来源于 omicsdi.org，归类于呼吸道疾病 / 真菌性肺部感染，主题标签为 Transcriptomics。研究围绕烟曲霉 Af293 在温度转换后的转录谱变化展开：首先在 30C 条件下使分生孢子萌发，随后将培养物转移至 37C 或 48C 继续生长，并在温度转换后的 0、15、30、60、120 和 180 分钟取样，用于转录谱分析。该数据集可用于观察烟曲霉在温度升高过程中基因表达的时间动态，为理解真菌性肺部感染相关生物学过程提供转录组层面的数据基础。
【数据集背景】
烟曲霉是一种与呼吸道疾病和真菌性肺部感染相关的真菌。该数据集以烟曲霉 Af293 为研究对象，关注其在温度转换条件下的转录谱变化。实验设计中的温度条件包括从 30C 转移至 37C 或 30C 转移至 48C，并在转换后多个时间点取样。这一背景说明该数据集的核心实验变量是温度转换后的时间，以及不同温度条件对转录活动的影响。源站描述中未提供更多关于疾病机制、宿主互作或临床背景的信息。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Transcriptomics，表明其内容属于转录组学范畴。实验材料为烟曲霉 Af293 的分生孢子，浓度描述为 5x106 /ml。分生孢子先在 CM 培养基中于 30C 条件下孵育约 17 小时以完成萌发。随后，培养物被转移至 37C 或 48C 的水浴中继续生长。取样时间点包括温度转换后的 0、15、30、60、120 和 180 分钟。源站未提供样本数量、测序平台、表达矩阵、差异基因列表或具体分析结果等信息。
【采集与来源】
该数据集来自 omicsdi.org，本站分类为呼吸道疾病 / 真菌性肺部感染。源站描述说明了实验处理流程：分生孢子以 5x106 /ml 的浓度在 CM 培养基中于 30C 萌发约 17 小时，之后转移至 37C 或 48C 水浴继续培养，并在定义的时间点取样。除上述来源与实验条件外，源站未提供关于采集地点、采集机构、原始数据文件格式或提交者等更多信息。
【适用场景】
该数据集适用于转录组学相关研究场景，尤其是关注烟曲霉在温度转换后基因表达时间动态的分析。由于实验涉及 30C 至 37C 以及 30C 至 48C 的温度变化，并覆盖 0、15、30、60、120 和 180 分钟多个时间点，可用于比较不同温度条件下短期转录响应的时间序列特征。其分类归属为呼吸道疾病 / 真菌性肺部感染，也可作为真菌性肺部感染相关基础研究中的转录组数据资源。源站未提供该数据集在具体临床、诊断或药物开发场景中的直接应用说明。
【使用方法】
该数据集可通过 omicsdi.org 获取，具体下载方式、数据格式、访问链接和分析流程源站未提供。使用者可根据源站描述理解实验设计：以 30C 萌发约 17 小时后的烟曲霉 Af293 培养物为起点，分别转移至 37C 或 48C，并在 0、15、30、60、120 和 180 分钟取样进行转录谱分析。若需进行后续分析，应结合源站提供的原始数据或处理数据说明。源站未提供标准分析步骤、软件推荐或代码示例。
【质量与限制】
该数据集基于明确的温度转换实验设计，包含两个温度条件和六个取样时间点，主题为 Transcriptomics。但源站未提供样本重复数、测序深度、数据质量控制指标、归一化方法或统计分析方法等信息。因此，无法从现有描述中判断数据的技术质量、生物学重复情况或结果稳健性。此外，源站未提供数据完整性、缺失值处理或潜在批次效应等信息。使用时应以源站实际提供的数据和元数据为准。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或版权信息。如需引用或使用，应查阅 omicsdi.org 上该数据集的原始页面以获取相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MEXP-332
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
实验因素：温度从30℃升至37℃或从30℃升至48℃后的时间。将烟曲霉Af293的孢子（5×10^6/ml）在CM培养基中于30℃培养约17小时以促进萌发。随后将培养物转移至37℃或48℃水浴中继续生长。在设定的时间点（即0、15、30、60、120和180分钟）取样。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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