烟曲霉菌pmcA-C基因体内微阵列实时RT-PCR数据集
该数据集为基因表达模态数据,包含烟曲霉菌在肺泡生长环境下pmcA-C基因的实时RT-PCR定量结果,通过β-微管蛋白内参标准化并以cDNA浓度比值形式呈现,主要用于真菌性肺部感染的病原体基因调控研究、致病机制分析和抗真菌治疗靶点探索。

基本信息
资源简介
烟曲霉菌pmcA-C基因体内微阵列实时RT-PCR数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Real-time RT-PCR for pmcA-C genes from the in vivo microarray.》。源站首次发布:2012-05-23。
【数据内容】
源站原始描述:*The mRNA abundance of A. fumigatus pmcA-C genes during growth in lung alveoli. Real-time RT-PCR was used to quantify mRNA abundance. The measured quantity of mRNA for a specific gene in each of the treated samples was normalized using the CT values obtained for the β-tubulin mRNA amplifications run on the same plate. The relative quantitation of a specific gene and β-tubulin gene expression was determined by a standard curve (i.e., CT –values plotted against a logarithm of the DNA copy number).…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 5.63 KB。Table_1.xls:application/vnd.ms-excel,5.63 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0037591.t001。
【主题与分类】
源站学科分类:Molecular Biology、Genetics、Microbiology。主题标签:rt-pcr、genes。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Molecular Biology、Genetics、Microbiology。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Real_time_RT_PCR_for_pmcA_C_genes_from_the_in_vivo_microarray_/305248
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Magnani Dinamarco, Taísa; Zanolli Freitas, Fernanda; S. Almeida, Ricardo; Andrew Brown, Neil; Fernanda dos Reis, Thaila; Naira Zambelli Ramalho, Leandra; et al. (2015). Real-time RT-PCR for pmcA-C genes from the in vivo microarray.. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-02,引用时请注意版本时效。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集记录了烟曲霉菌(Aspergillus fumigatus)在肺泡内生长期间pmcA-C基因的mRNA丰度。通过实时RT-PCR技术进行基因表达定量,并使用β-微管蛋白基因作为内参进行标准化处理,通过标准曲线计算相对表达量。数据来源于四次独立实验,以平均值±标准差的形式呈现,具体数值为特定基因cDNA浓度与β-微管蛋白cDNA浓度的比值。该数据集主要用于研究真菌在肺部感染过程中的基因表达调控,适用于病原体-宿主相互作用、真菌致病机制及抗真菌药物靶点探索等研究方向。
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