TCGA肺鳞癌泛癌分析数据集
该数据集整合TCGA肺鳞癌泛癌分析数据,包含基因突变、拷贝数变异及临床生存信息,用于肺癌分子机制研究与跨癌种比较分析。

基本信息
资源简介
TCGA肺鳞癌泛癌分析数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Lung Squamous Cell Carcinoma (TCGA, PanCancer Atlas)》。
【数据内容】
源站原始描述:Lung Squamous Cell Carcinoma TCGA PanCancer data. The original data is here . The publications are here
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:pmid:29625048,29596782,29622463,29617662,29625055,29625050,29617662,30643250,32214244,29625049,29850653,36334560。
【主题与分类】
主题标签:lusc。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=lusc_tcga_pan_can_atlas_2018
规范引用:TCGA, Cell 2018
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=lusc_tcga_pan_can_atlas_2018
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集基于TCGA肺鳞癌样本构建泛癌分析数据集合,提供基因突变、表达谱及临床数据,用于癌症异质性分析与肺癌亚型研究。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




