CPTAC肺腺癌蛋白质组数据集
CPTAC-LUAD 是肺腺癌蛋白质组数据集，结合基因组与临床信息，支持肺癌蛋白表达分析、分子机制研究及多组学整合分析与预后建模。
基本信息
资源简介
CPTAC肺腺癌蛋白质组数据集
【一句话概览】
美国国家癌症研究所的癌症临床蛋白质组学研究办公室（OCCPR）致力于将蛋白质组学和蛋白质基因组学整合到癌症研究科学中，以改善癌症诊断、治疗和结果。该机构专注于临床癌症蛋白质基因组学的前沿研究，并邀请公众保持联系以了解其工作进展。其工作涉及蛋白质组学、蛋白质基因组学、癌症和临床蛋白质组学等领域（来源 proteomics.cancer.gov）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Office of Cancer Clinical Proteomics Research (OCCPR)》。
【数据内容】
源站原始描述：Welcome to the Office of Cancer Clinical Proteomics Research (OCCPR), your dedicated organization for integrating proteomics and proteogenomics into cancer research science to improve cancer diagnosis, treatments, and outcomes. Stay connected with us as we work towards groundbreaking research in clinical cancer proteogenomics
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：欢迎来到癌症临床蛋白质组学研究办公室（OCCPR），我们是一个致力于将蛋白质组学和蛋白质基因组学整合到癌症研究科学中，以改善癌症诊断、治疗和预后的专门机构。请与我们保持联系，共同致力于临床癌症蛋白质基因组学领域的突破性研究。
【主题与分类】
主题标签：proteomics、proteogenomics、cancer、clinical proteomics。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面：https://proteomics.cancer.gov/programs/cptac
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://proteomics.cancer.gov/programs/cptac
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 10.00 GB。
数据说明
CPTAC-LUAD 提供肺腺癌患者的蛋白质组学数据，并结合基因组与临床信息，用于研究肺癌蛋白表达变化及其与基因突变和生存结果之间的关系。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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