COPD基因研究队列数据集
COPDGene 是典型的小气道疾病研究数据集,涵盖吸烟人群胸部CT影像、肺功能测试及基因组信息,主要用于COPD及细支气管病变的机制分析、影像组学研究与疾病进展预测。
基本信息
资源简介
COPDGene 是由美国NIH资助的大型慢性阻塞性肺疾病研究数据集,包含吸烟人群的胸部CT影像、肺功能检测、基因组数据及临床表型信息,用于研究COPD及小气道(细支气管)相关疾病的发病机制与进展规律。
下载信息
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暂未开放公开下载
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000179.v6.p2
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 1200.00 GB。
数据说明
COPDGene 是由美国NIH资助的大型慢性阻塞性肺疾病研究数据集,包含吸烟人群的胸部CT影像、肺功能检测、基因组数据及临床表型信息,用于研究COPD及小气道(细支气管)相关疾病的发病机制与进展规律。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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