学龄前喘息与哮喘急性发作儿童的鼻腔微生物组：来自德国儿科急性发作网络的研究

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD024694

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管鼻子作为生物体与环境相互作用的门户，可能在哮喘加重中发挥关键作用，但迄今为止，哮喘加重期儿童的鼻部微生物组在很大程度上被忽视。研究采用深部鼻咽拭子标本、鼻上皮球状体培养物（NAEsp）以及急性加重期喘息患儿（WH）、哮喘患儿（AB）和健康对照（HC）的血液样本，进行了培养（n=146）、16S rRNA基因扩增子测序（n=64）、蛋白质组学和细胞因子分析。有趣的是，变形菌门在WH中过度富集（WH与AB相比：p=0.005；WH与HC相比：p=0.021），而厚壁菌门和拟杆菌门与AB相关。相比之下，放线菌门通常定植于HC（PermANOVA p=0.005）。此外，与WH和HC相比，葡萄球菌科（p<0.05）、肠杆菌科（p<0.05）、伯克霍尔德菌科（p<0.05）、黄色杆菌科（p<0.05）和鞘脂单胞菌科（p<0.05）在AB中显著更为丰富。α多样性分析表明，特应性AB中细菌丰度水平增加，而WH样本中则降低。特应性WH的微生物组谱与特应性AB存在显著差异。NAEsp细菌暴露于卡他莫拉菌、金黄色葡萄球菌和H.

流感嗜血杆菌实验显示上皮细胞完整性受损、细胞因子释放以及队列特异性的蛋白质组差异，尤其在卡他莫拉菌培养中更为明显。我们的综合数据集有助于更深入地了解鼻腔微生物群中鲜为人知的可塑性，特别是可能加强我们对儿童哮喘急性发作发病机制的理解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。