鼻病毒与IL-13改变儿童支气管上皮细胞哮喘关键位点DNA甲基化

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.3ffbg79zc

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 8.5 MB。

数据说明

在获得IRB批准、家长同意及捐赠者本人同意的情况下，从10名哮喘儿童和6名健康儿童中，通过择期手术期间获取的支气管刷检样本，建立了器官型BEC培养。BEC捐赠者在初次研究访问时进行了特征描述，以确认诊断和病史，并记录肺功能测定及呼出气一氧化氮分数测量结果。在分化为器官型、假复层状态后，BEC培养物以0.5的MOI感染RV-16，或以10 ng/mL的浓度用IL-13刺激。RV16感染后10天及IL-13处理后7天收集RNA和DNA。收集的RNA通过RNA测序分析基因表达，DNA中的DNA甲基化则使用Asthma & Allergy芯片进行定量。读取序列经过质量控制后，与人类基因组（GRCh38，Ensembl 91）比对。基因经过滤，仅保留蛋白质编码基因及甲基化数据集中的最近基因注释，最终得到包含3,827个基因的表达数据集。数据按照IRB协议并遵循所有伦理和法律指南进行了匿名化处理。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。