基本信息

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分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA509680：U-BIOPRED 哮喘或喘息儿童血液转录组学

PRJNA509680 是 NCBI BioProject 数据库中的一个项目记录，主题为 U-BIOPRED 哮喘或喘息儿童的血液转录组学。该数据集归属于呼吸系统疾病中的哮喘方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，主题标签为 Transcriptome or Gene expression。BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录形式，通常源自单一机构或联合体，并为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。该项目聚焦儿童哮喘或喘息人群的血液转录组学研究，属于呼吸系统疾病中哮喘方向的组学数据资源，可为相关基因表达研究提供项目层面的索引与数据链接。

【数据集背景】

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA509680，英文名称为“U-BIOPRED blood transcriptomics from children with asthma or wheeze”。从名称可以看出，该项目围绕 U-BIOPRED 研究框架下儿童哮喘或喘息受试者的血液转录组学展开。BioProject 作为生物数据项目的组织单元，其作用是将与同一研究计划相关的多种数据类型集中关联，便于用户从一个记录出发访问项目所生成的数据资源。该记录在分类上归入呼吸系统疾病 / 哮喘方向，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其核心数据类型与转录组或基因表达相关。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，指向血液转录组学数据。项目名称明确其研究对象为哮喘或喘息的儿童，样本类型为血液。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、基因表达矩阵格式、临床变量等更细化的数据内容说明。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，以 BioProject 记录形式发布，编号 PRJNA509680。BioProject 记录通常源自单一机构或联合体，用于汇集单一研究计划产生的生物数据。源站描述说明了 BioProject 的一般性质，但未提供该项目的具体提交机构、采样地点、采集时间或伦理审批等信息。

【适用场景】

基于其主题，该数据集可用于与儿童哮喘或喘息相关的血液基因表达研究，例如转录组层面的差异表达分析、候选基因筛选，以及与其他哮喘组学数据的整合比较。主题标签 Transcriptome or Gene expression 表明其适用于基因表达相关分析场景。具体适用场景的细节，源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录（编号 PRJNA509680）访问该项目，并借助记录中的链接查找该项目产生的多种数据类型。关于数据下载方式、文件格式、分析流程或配套工具，源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估、数据完整性、批次效应或技术验证等信息。使用时应注意到，BioProject 记录本身是项目索引，具体数据质量需依据其链接的数据资源判断。相关限制说明源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA509680

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA509680

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

哮喘是一种气道炎症性疾病，以发作性气道阻塞为特征，导致咳嗽和发作性气短。该病在临床和生理上具有异质性。据估计，全球约有3亿人被诊断患有哮喘，其中包括高达20%的儿童（Asher等，2006），而这些儿童中有5%–10%被认为患有重度或难以治疗的哮喘。哮喘通常根据严重程度和临床诊断标准进行分类，但现已明确，生理层面存在的异质性同样是潜在病理机制的一个特征（Lotvall等，2011）。本研究旨在确定被诊断为哮喘或喘息的儿童的血浆转录组学特征，并确定这些特征是否提示可作为这些儿童疾病基础的內型或机制，或与疾病严重程度相关。

重要的是，鉴于目前儿童与成人使用相同的药物进行治疗，我们还旨在比较儿童与成人哮喘患者的特征，以帮助确定是否应将努力方向集中于开发针对儿童特有通路和机制的药物。为此，我们使用了U-BIOPRED联盟从成人和儿童血液样本中生成的基因转录组数据，以探究在现行定义下，成人组与患有重度或轻中度哮喘的学龄前或学龄期儿童（学龄前儿童为喘息）组之间的差异基因表达谱的相似或差异程度。呼吸系统疾病结局预测的无偏生物标志物（U-BIOPRED）项目是在创新药物倡议（IMI）框架内建立的公私合作项目，汇集了学术界、制药行业和患者团体。本研究的目的是识别转录

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别