PRJNA480892：嗜酸性和中性粒细胞性哮喘患者lncRNA表达分析
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 480892），主题为嗜酸性和中性粒细胞性哮喘患者的 lncRNA 表达分析，属于呼吸系统疾病/哮喘方向，主题标签为 Transcriptome or Gene expression
基本信息
资源简介
PRJNA480892：嗜酸性和中性粒细胞性哮喘患者lncRNA表达分析
PRJNA480892 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库中的生物项目，其英文名称为“lncRNA expression analysis in patients with eosinophilic and neutrophilic asthma”，中文可译为“嗜酸性和中性粒细胞性哮喘患者的 lncRNA 表达分析”。该项目围绕哮喘这一呼吸系统疾病展开，聚焦于不同炎症表型患者中长链非编码 RNA（lncRNA）的表达情况。从主题标签来看，该项目归属于“Transcriptome or Gene expression”（转录组或基因表达）方向，说明其数据核心与基因表达谱相关。整体而言，该数据集为研究哮喘患者 lncRNA 表达差异提供了来自 NCBI BioProject 的公开资源入口，便于研究者定位和获取与该项目相关的多种数据类型。
【数据集背景】
哮喘是一种常见的呼吸系统疾病，其临床表现和病理机制具有明显的异质性。根据气道炎症细胞类型的不同，哮喘常被区分为嗜酸性粒细胞性哮喘和中性粒细胞性哮喘等表型。不同表型在发病机制、治疗反应和预后方面可能存在差异，因此针对不同表型开展分子层面的研究具有重要意义。长链非编码 RNA 是一类不编码蛋白质的 RNA 分子，近年来被发现参与基因表达调控等多种生物学过程。该数据集正是围绕嗜酸性和中性粒细胞性哮喘患者的 lncRNA 表达分析而建立，旨在从转录组或基因表达层面切入，探索不同哮喘表型中 lncRNA 的表达特征。其所属分类为呼吸系统疾病/哮喘，主题标签为 Transcriptome or Gene expression。
【数据内容】
该数据集的主题为嗜酸性和中性粒细胞性哮喘患者的 lncRNA 表达分析，属于转录组或基因表达范畴。作为 NCBI BioProject 中的一条记录，它对应的是一个生物项目，而非单一类型的数据文件。BioProject 的定位是将与某一项研究计划相关的多种数据类型汇聚在一起，使用户能够通过一个统一的入口找到由该项目产生的不同数据类型的链接。因此，该数据集所涵盖的具体数据内容，可能涉及与 lncRNA 表达分析相关的多种数据形式，但源站未提供该项目下具体包含哪些数据文件、样本数量、表达矩阵或分析结果等细节。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）的网站。其记录类型为 BioProject，项目 ID 为 480892。根据源站描述，BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合，这些计划可能来自单一组织，也可能来自一个联合体；BioProject 记录为用户提供一个统一的位置，以便找到为该计划产生的多种数据类型所对应的链接。该数据集即通过 NCBI BioProject 平台对外发布和索引。关于样本采集地点、采集时间、受试者招募方式、伦理审批信息以及具体实验流程等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病尤其是哮喘相关的分子机制研究，特别是关注嗜酸性粒细胞性哮喘与中性粒细胞性哮喘之间差异的研究。由于主题标签为 Transcriptome or Gene expression，它可用于转录组或基因表达分析方向的探索，例如 lncRNA 表达谱的比较研究。对于希望寻找公开转录组或基因表达数据资源的研究人员，该 BioProject 记录可作为获取相关数据链接的入口。此外，该数据集也可用于生物信息学方法开发、公共数据整合分析等场景。但具体适用性需结合该项目实际包含的数据类型和实验设计来判断，源站未提供相关细节。
【使用方法】
作为 NCBI BioProject 中的一条记录，该数据集可通过其项目 ID 480892 在 NCBI BioProject 数据库中进行检索和访问。用户可通过该记录找到指向该项目所产生的多种数据类型的链接，进而获取所需数据。BioProject 的设计目的正是为用户提供单一入口，以便发现与某一研究计划相关的不同数据资源。因此，典型的使用方式包括：在 NCBI BioProject 中定位该项目，查看其关联的数据类型和子项目，再根据研究需要下载或跳转至相应的数据资源。关于具体的数据下载格式、分析工具、处理流程等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开的生物项目记录。其质量与可靠性依赖于源站及项目提交方所提供的信息。需要指出的是，BioProject 记录本身主要起到汇集和索引的作用，提供的是指向多种数据类型的链接，而非对数据质量的直接评价。关于该项目的样本量、实验重复、数据完整性、批次效应、统计方法以及潜在偏倚等具体质量指标，源站未提供。此外，该数据集聚焦于嗜酸性和中性粒细胞性哮喘患者的 lncRNA 表达分析，其结论的外推范围可能受限于研究设计本身，源站未提供相关信息。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI BioProject，项目 ID 为 480892，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否存在使用限制等信息，源站未提供。用户在使用时应遵循 NCBI 及 BioProject 的相关政策和通用规范，并建议查阅该项目的原始记录以获取最新的引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA480892
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
长链非编码RNA（lncRNA）已知在多种疾病中具有重要作用。已有一些报道表明，lncRNA参与哮喘全身性炎症的发病机制。lncRNA调控基因转录、蛋白表达及表观遗传调控。然而，与不同气道表型（如嗜酸性粒细胞型和中性粒细胞型哮喘）相关的lncRNA仍不清楚。我们旨在鉴定嗜酸性粒细胞型（Eos）和中性粒细胞型（Neu）样本中循环lncRNA特征的差异。研究比较了Eos患者、Neu患者和健康个体（对照）血液样本之间的lncRNA表达。采用生物信息学分析描述相关生物学通路。使用定量实时PCR测定lncRNA表达。与对照样本相比，Eos样本有190个特异性lncRNA，Neu样本有166个特异性lncRNA（差异≥2倍）。KEGG通路注释数据和GO术语显示，若干lncRNA可能与各自表型相关。通过qRT-PCR鉴定出lncRNA在Eos和Neu样本间存在显著差异。结果表明，lncRNA可能参与哮喘的不同表型。
我们能否通过这些lncRNA（作为生物标志物）识别哮喘的不同表型，尚需进一步研究。总体设计：本研究根据公认标准（嗜酸性粒细胞型：诱导痰嗜酸性粒细胞计数>3%且中性粒细胞<63%；中性粒细胞型：诱导痰嗜酸性粒细胞计数<3%且中性粒细胞>63%）1，选取嗜酸性粒细胞型哮喘患者（Eos，n = 12）和中性粒细胞型哮喘患者（Neu，n = 6）。排除标准包括近期（过去几周内）呼吸道感染、近期哮喘不稳定、近期哮喘急性发作、当前吸烟（或戒烟6个月内的吸烟史），以及维持治疗方案发生变化。所有参与者均选自中国人民解放军总医院，且所有参与者在纳入前均已签署知情同意书。健康个体
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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