PRJNA400177：TLR2配体（几丁质寡聚体、Pam2、Pam3）和TLR4配体LPS刺激后全血基因表达
数据属于转录组或基因表达范畴，本站将其归类于呼吸系统疾病/哮喘。可用于研究不同 TLR 配体刺激下全血转录组反应，比较 TLR2 与 TLR4 通路激活的基因表达差异，并为哮喘等呼吸系统疾病的免疫机制探索提供表达谱资源（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
PRJNA400177：TLR2配体（几丁质寡聚体、Pam2、Pam3）和TLR4配体LPS刺激后全血基因表达
PRJNA400177 是一个来源于 NCBI BioProject 数据库的人类（Homo sapiens）转录组或基因表达数据集，其英文全称为 Whole blood gene expression after stimulation with TLR2 ligands (chitin oligomers, Pam2, Pam3) and the TLR4-ligand LPS。该数据集记录了全血样本在受到 TLR2 配体（包括几丁质寡聚物、Pam2、Pam3）以及 TLR4 配体 LPS 刺激后的基因表达情况，主题标签为 Transcriptome or Gene expression。本站将其归类于呼吸系统疾病 / 哮喘方向，提示该数据集可为研究不同 TLR 配体刺激下全血转录组反应、比较 TLR2 与 TLR4 通路激活的基因表达差异，以及探索哮喘等呼吸系统疾病的免疫机制提供表达谱资源。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 400177，物种为 Homo sapiens。BioProject 是围绕某一项研究计划而汇集生物数据的集合，这些数据可来自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。该项目的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其核心数据类型属于转录组或基因表达范畴。本站将其分类于呼吸系统疾病 / 哮喘，说明该数据集在应用层面与呼吸系统疾病特别是哮喘的研究方向存在关联。
【数据内容】
该数据集的内容为全血基因表达数据，具体涉及全血样本在接受 TLR2 配体（几丁质寡聚物、Pam2、Pam3）以及 TLR4 配体 LPS 刺激后的转录组反应。数据主题标签为 Transcriptome or Gene expression，说明其记录的是基因表达层面的信息。该数据集可用于研究不同 TLR 配体刺激下全血转录组反应，比较 TLR2 与 TLR4 通路激活的基因表达差异。关于样本数量、测序平台、具体基因列表、表达量数值等详细信息，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的记录，项目编号为 400177，物种为 Homo sapiens。BioProject 记录汇集了与单一研究计划相关的生物数据，这些数据可来自单一组织或联合体，并为用户提供查找该项目所产生多种数据类型的统一入口。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体研究机构等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于以下研究方向：研究不同 TLR 配体刺激下全血转录组反应；比较 TLR2 与 TLR4 通路激活的基因表达差异；为哮喘等呼吸系统疾病的免疫机制探索提供表达谱资源。由于本站将其归类于呼吸系统疾病 / 哮喘，该数据集可用于与呼吸系统疾病特别是哮喘相关的免疫机制研究。关于其他具体应用场景，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库访问，项目编号为 400177。用户可通过 BioProject 记录查找与该项目相关的多种数据类型。关于具体的数据下载方式、分析流程、软件工具推荐等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开的生物数据集合。关于数据质量评估指标、样本量大小、测序深度、数据完整性、潜在偏差等具体质量与限制信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject，编号为 400177。关于具体的引用格式、许可条款、使用限制等信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA400177
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
几丁质是自然界中第二丰富的多糖，也是一种与真菌感染和过敏性哮喘密切相关的生物分子，这些疾病影响着全球数百万患者。已知几丁质能刺激多种哺乳动物免疫细胞，但其精确的分子感知机制尚未阐明，这阻碍了针对几丁质介导病理的精准策略的开发。与本微阵列数据集相关的研究使用确定的几丁质寡聚体，鉴定出六个几丁质亚基作为最小的免疫活性几丁质基序，并确定先天免疫受体TLR2作为人和鼠免疫细胞在体外和体内的分子几丁质传感器。该微阵列数据集的目标是阐明人全血细胞在响应几丁质、其他TLR2配体（Pam2、Pam3）以及TLR4配体LPS时的转录差异。所有四种刺激物相互比较，并与未刺激的全血样本作为参考进行比较。我们得出结论，与经典TLR2配体相比，几丁质寡聚体引发重叠但不同的信号传导结果。
总体设计：将全血与不同刺激物（几丁质寡聚物、Pam2CSK4、Pam3CSK4、脂多糖）共同孵育三小时，或不加刺激物（未刺激对照），以表征几丁质相较于其他TLR配体所引发的转录反应。五种条件均在相同的五名患者中重复进行，唯独脂多糖仅在其中三名患者中重复，总计23份样本。未刺激的全血作为参考样本。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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