基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA121933：哮喘儿童急性加重期伴或不伴慢性气流阻塞的诱导痰表达谱

PRJNA121933 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物学项目数据集，主题标签为转录组或基因表达，聚焦于哮喘儿童在急性加重期伴或不伴慢性气流阻塞情况下诱导痰中的基因表达情况。该数据集所属分类为呼吸系统疾病 / 哮喘，源站为 ncbi.nlm.nih.gov。作为 BioProject 体系下的一条记录，它为用户提供了一个集中入口，用以查找围绕这一研究计划所产生的多种类型数据。整体而言，该数据集面向呼吸系统疾病尤其是儿童哮喘急性加重机制的研究需求，以转录组层面的基因表达信息为核心内容，适合关注哮喘气道炎症与气流阻塞相关分子特征的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集对应的英文名称为“PRJNA121933: Expression in induced sputum during acute exacerbations in asthmatic children with/without chronic airflow obstruction”，源站标题为“Homo sapiens (ID 121933) - BioProject - NCBI”。从名称可以看出，该研究计划关注的是人类（Homo sapiens）哮喘儿童群体，研究情境设定为急性加重期，并按照是否伴有慢性气流阻塞进行区分，检测对象为诱导痰。BioProject 作为生物数据集合，通常源自单一机构或联合体发起的单一研究计划，其记录的作用是让用户在一个位置找到该项目所产生的各类数据链接。该数据集在分类上归入呼吸系统疾病 / 哮喘，主题标签为转录组或基因表达，说明其核心数据属于基因表达层面的转录组信息。

【数据内容】

依据源站描述，BioProject 记录本身是围绕单一研究计划组织起来的生物数据集合，提供指向该项目所生成多种数据类型的链接入口。该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。结合数据集名称可知，所涉及的表达数据来自哮喘儿童急性加重期的诱导痰样本，并按伴或不伴慢性气流阻塞进行分组比较。除上述主题与样本情境信息外，关于具体样本数量、检测平台、表达矩阵规模、差异表达基因列表等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 数据库，项目标识为 ID 121933，源站标题标明物种为 Homo sapiens。数据产生于单一研究计划，该计划聚焦哮喘儿童急性加重期诱导痰中的基因表达。关于样本采集的具体流程、招募机构、伦理审批信息、采样时间点与临床随访安排等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于呼吸系统疾病特别是儿童哮喘研究方向的使用场景，包括：探讨哮喘急性加重期气道内基因表达特征；比较伴慢性气流阻塞与不伴慢性气流阻塞的哮喘儿童在诱导痰转录组层面的差异；为哮喘气道炎症相关生物标志物研究提供表达数据参考；以及作为转录组或基因表达类研究的辅助数据资源。由于主题标签明确为转录组或基因表达，其典型用途围绕基因表达分析展开。关于具体可支持的统计或临床结论，源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录（ID 121933）作为入口，查找该研究计划所关联的各类数据资源链接。BioProject 记录的设计目的即在于集中呈现同一项目产生的多种数据类型，因此使用时应先访问该记录页面，再沿其提供的链接获取相应的表达数据。关于数据下载格式、分析流程、预处理步骤与推荐工具，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 记录层面的资源入口，其描述侧重于项目组织与数据链接，而非对数据质量指标的说明。关于样本量、数据完整性、质控标准、批次效应处理以及结果的验证情况，源站未提供。使用者在引用该数据集开展分析时，应注意到项目记录本身不直接等同于经过统一质控的分析结果集。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可条款与使用限制，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA121933

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA121933

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

哮喘急性发作与随后肺功能受损相关。在此，我们检验了以下假设：急性发作期间特定模式的炎症反应可能与慢性气道阻塞的易感性相关。总体设计：研究设计包括20名哮喘儿童；10名儿童基线时FEV1/FVC比值相对较低，10名儿童基线时FEV1/FVC比值相对较高。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别