PRJNA1047533:III组磷脂酶A2缺失在抗原诱导哮喘模型肺中的作用

该数据集来自NCBI,聚焦呼吸系统疾病中的哮喘,主题为转录组或基因表达。源站描述指出,研究探讨III组分泌型磷脂酶A2(sPLA2-III)在哮喘病理中的作用,发现其在支气管上皮细胞表达且哮喘反应时下降,Pla2g3-/-小鼠在OVA诱导哮喘模型中表现出气道高反应性、嗜酸性粒细胞增多、OVA特异性I

sra
浏览 11
基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1047533: Effect of group III phospholipase A2 deletion in antigen-induced asthma modeled lung

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1047533:III组磷脂酶A2缺失在抗原诱导哮喘模型肺中的作用

该数据集来自NCBI,聚焦呼吸系统疾病中的哮喘,主题为转录组或基因表达。源站描述指出,研究探讨III组分泌型磷脂酶A2(sPLA2-III)在哮喘病理中的作用,发现其在支气管上皮细胞表达且哮喘反应时下降,Pla2g3-/-小鼠在OVA诱导哮喘模型中表现出气道高反应性、嗜酸性粒细胞增多、OVA特异性IgE产生及2型细胞因子表达增强。数据可用于分析基因表达变化与哮喘相关表型的关系(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):哮喘是一种慢性气道炎症性疾病,以反复发作的气道阻塞、高反应性、重塑和嗜酸性粒细胞增多为特征。磷脂酶A2(PLA2)从膜磷脂释放脂肪酸和溶血磷脂,通过产生促哮喘脂质介质被认为参与加重哮喘,但对单个PLA2亚型与哮喘之间关联的理解仍不完整。在此,我们显示III组分泌型PLA2(sPLA2-III)在哮喘病理中发挥改善而非加重的作用。在小鼠和人肺中,sPLA2-III在支气管上皮细胞中表达,并在哮喘反应期间降低。在卵清蛋白(OVA)诱导的哮喘模型中,Pla2g3-/-小鼠表现出增强的气道高反应性、嗜酸性粒细胞增多、OVA特异性IgE产生和2型细胞因子表达

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1047533

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1047533

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

哮喘是一种慢性气道炎症性疾病,以反复发作的气道阻塞、高反应性、重塑和嗜酸性粒细胞增多为特征。磷脂酶A2(PLA2s)可从膜磷脂中释放脂肪酸和溶血磷脂,通过生成促哮喘脂质介质被认为参与加重哮喘,但对各PLA2亚型与哮喘之间关联的认识仍不完整。在此,我们表明III组分泌型PLA2(sPLA2-III)在哮喘病理中发挥改善而非加重作用。在小鼠和人肺中,sPLA2-III表达于支气管上皮细胞,并在哮喘反应期间降低。在卵清蛋白(OVA)诱导的哮喘模型中,与Pla2g3+/+小鼠相比,Pla2g3-/-小鼠表现出增强的气道高反应性、嗜酸性粒细胞增多、OVA特异性IgE产生和2型细胞因子表达。脂质组学分析显示,与Pla2g3+/+小鼠相比,OVA攻击的Pla2g3-/-小鼠肺中多种溶血磷脂水平降低,包括溶血磷脂酰胆碱、溶血磷脂酰乙醇胺和溶血磷脂酸(LPA)。

LPA受体2激动剂抑制了支气管上皮细胞中胸腺基质淋巴细胞生成素的表达,并逆转了Pla2g3-/-小鼠的气道高反应性和嗜酸性粒细胞增多,提示sPLA2-III至少通过产生LPA对过敏原诱导的哮喘发挥负调控作用。因此,激活sPLA2-III-LPA通路可能成为过敏性哮喘的新治疗靶点。对OVA激发肺组织的微阵列基因谱分析显示,与Pla2g3+/+小鼠相比,Pla2g3-/-小鼠中与细胞因子和炎症反应相关的基因发生了高度改变。总体设计:模型,抗原(OVA)诱导的哮喘。小鼠在第0天和第14天通过腹腔注射卵清蛋白(10 µg)加1.3 mg氢氧化铝(铝佐剂)进行致敏。在第26、27和28天,小鼠被激发

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案