PRJNA1047532:III组磷脂酶A2缺失对抗原诱导哮喘模型中支气管上皮细胞基因表达的影响

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1047532),主题为转录组或基因表达,属于呼吸系统疾病中的哮喘分类

sra
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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1047532: Effect of group III phospholipase A2 deletion on gene expression in bronchial epithelial cells in an antigen-induced asthma model.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1047532:III组磷脂酶A2缺失对抗原诱导哮喘模型中支气管上皮细胞基因表达的影响

PRJNA1047532 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物研究项目记录,英文标题为“Effect of group III phospholipase A2 deletion on gene expression in bronchial epithelial cells in an antigen-induced asthma model”。从标题可以看出,该研究关注 III 组磷脂酶 A2 缺失在抗原诱导哮喘模型中对支气管上皮细胞基因表达的影响。该数据集在本站归入呼吸系统疾病下的哮喘分类,主题标签为转录组或基因表达。BioProject 作为生物数据的汇集入口,将同一项研究计划产生的多种数据类型集中关联,便于用户从一个记录出发查找该项目所生成的数据资源。以下依据可获得的信息对该数据集作进一步介绍。

【数据集背景】

该数据集对应的是一项以哮喘为研究背景的生物学项目。哮喘属于呼吸系统疾病,而本项目聚焦于抗原诱导的哮喘模型,并以支气管上皮细胞为研究对象,考察 III 组磷脂酶 A2 缺失对基因表达的影响。项目记录来源于 NCBI BioProject,编号为 1047532。BioProject 的定位是汇集源自单一机构或联合体的、与同一项研究计划相关的生物数据,并为用户提供查找该项目所产生各类数据的统一入口。因此,该记录本身是一个项目层面的索引性条目,而非单一实验数据文件。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,即转录组或基因表达。结合项目标题可知,其数据内容围绕支气管上皮细胞在抗原诱导哮喘模型条件下、伴随 III 组磷脂酶 A2 缺失时的基因表达情况展开。关于具体的样本数量、测序平台、数据文件格式与规模等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,记录标识为 BioProject ID 1047532。项目英文名称明确指向抗原诱导哮喘模型中的支气管上皮细胞基因表达研究。关于样本采集的具体方法、实验设计细节、动物模型构建方式以及数据处理流程,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与项目标题,该数据集可适用于与哮喘相关的基因表达与转录组研究场景,例如关注支气管上皮细胞在哮喘模型中的表达变化,或关注 III 组磷脂酶 A2 缺失对上述表达变化影响的研究工作。此外,由于该记录属于 BioProject 项目条目,也可用于了解该项目所关联的数据类型与资源入口。关于更具体的适用分析类型,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 NCBI BioProject 记录(ID 1047532)提供访问入口,用户可由该记录查找该项目所生成的各类关联数据。关于数据下载方式、文件组织格式、分析流程与配套工具等具体使用说明,源站未提供。

【质量与限制】

该记录为 BioProject 项目层面的描述条目,其作用在于汇集与索引同一研究计划下的数据,而非直接呈现实验结果。关于数据质量评估、质控指标、样本量、批次信息及潜在偏倚等,源站未提供。使用时应结合项目关联的具体数据资源加以判断。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1047532

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

哮喘是一种慢性气道炎症性疾病,以反复发作的气道阻塞、高反应性、重塑和嗜酸性粒细胞增多为特征。磷脂酶A2(PLA2s)可从膜磷脂中释放脂肪酸和溶血磷脂,通过生成促哮喘脂质介质而参与加重哮喘,但对各PLA2亚型与哮喘之间关联的认识仍不完整。在此,我们发现III组分泌型PLA2(sPLA2-III)在哮喘病理中发挥改善而非加重作用。在小鼠和人肺中,sPLA2-III表达于支气管上皮细胞,并在哮喘反应过程中降低。在卵清蛋白(OVA)诱导的哮喘模型中,与Pla2g3野生型(+/+)小鼠相比,Pla2g3敲除(-/-)小鼠表现出增强的气道高反应性、嗜酸性粒细胞增多、OVA特异性IgE产生和2型细胞因子表达。

脂质组学分析显示,与Pla2g3+/+小鼠相比,OVA攻击的Pla2g3-/-小鼠肺部多种溶血磷脂水平降低,包括溶血磷脂酰胆碱、溶血磷脂酰乙醇胺和溶血磷脂酸(LPA)。LPA受体2激动剂抑制了支气管上皮细胞中胸腺基质淋巴细胞生成素的表达,并逆转了Pla2g3-/-小鼠的气道高反应性和嗜酸性粒细胞增多,提示sPLA2-III至少通过产生LPA对过敏原诱导的哮喘发挥负调控作用。因此,sPLA2-III-LPA通路的激活可能成为过敏性哮喘的新治疗靶点。对OVA攻击肺组织分离的支气管上皮细胞进行微阵列基因谱分析显示,与Pla2g3+/+小鼠相比,OVA攻击后Pla2g3-/-小鼠支气管上皮细胞中多种趋化因子和2型上皮细胞因子的表达增加。总体设计:模型,抗原(OVA)诱导的哮喘。小鼠通过腹腔注射致敏

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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