过敏性疾病中的肥大细胞活化检测

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03406325

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：哮喘、肥大细胞增多症、肥大细胞活化综合征、食物过敏、慢性特发性荨麻疹、过敏反应、湿疹。本研究旨在评估严重过敏性疾病患者是否表现出高水平肥大细胞活化，通过研究者开发的肥大细胞活化诊断测试来确定。他们预期，有严重过敏反应史的患者在基于血液的肥大细胞活化诊断测试中将显示为高反应者。此外，采用微阵列分析作为基因表达研究方法，他们进一步预期，能够轻易识别出与这些患者来源的体外肥大细胞高功能活化相关的基因组生物标志物。将从每位患者抽取约100毫升外周静脉血，注入肝素化注射器，并收集于含硅胶的采血袋/管中。该袋/管将立即按照先前开发的方案进行处理，以生成原代人肥大细胞培养物[Inflammation Research 66: 25 (2017)]。

培养9周后，将对所获得的人类肥大细胞进行分析，评估其功能活性，即通过高亲和力免疫球蛋白E（IgE）受体激活后组胺释放的情况，以及利用微阵列分析其基因表达谱。体外功能与基因组学数据将与特定诊断及血液中前列腺素D2（PGD2）、PGD2代谢物、类胰蛋白酶和组胺水平的测量结果相关联。对于介质测定，将在CD34+分离步骤后收集每位受试者的血浆，样品将分装并冻存于-80摄氏度，以备后续分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。