GSE277308：轻至中度马哮喘细胞学表型的独特分子谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE277308

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目采用先进的多组学方法，以加深我们对赛马中一种高发病率、限制运动表现疾病——轻至中度马哮喘（MMEA）——病因发病机制的理解。这一深入认识是改善该病症预防、管理和治疗选择的前提条件。尽管已确定MMEA的若干危险因素，但对该综合征确切病因发病机制的认识尚不完整，这意味着目前的干预选择有限。本研究旨在应用多组学方法，揭示参与炎症细胞募集至下气道的關鍵炎症通路，并突出不同MMEA炎症细胞表型（MMEA内型）所特有的通路。因此，我们比较了支气管肺泡灌洗液（BALF）细胞学正常的马（n = 8）与患有中性粒细胞性（n = 4）、肥大细胞性（n = 8）、混合中性粒细胞性/肥大细胞性（n=4）及混合嗜酸性粒细胞性/肥大细胞性（n=3）炎症的马所分离的BALF细胞基因和蛋白表达数据。

对来源于中性粒细胞学马匹支气管肺泡灌洗液（BALF）细胞的转录组和蛋白质组数据进行分析显示，经典炎症通路富集；而细胞学表现为肥大细胞的马匹则显示与超敏反应相关的通路富集，这些通路涉及非经典炎症，可能模拟Th2免疫反应。嗜酸性/肥大细胞混合组也呈现非经典炎症特征，而中性粒细胞/肥大细胞混合组则显示出与中性粒细胞炎症和超敏反应均一致的特征。我们采用的多组学方法（同时检测基因和蛋白质表达）能够更全面地评估与马哮喘不同细胞学表型相关的下呼吸道免疫状态。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。