哮喘、哮喘缓解期与健康受试者支气管活检RNAseq基因表达
该数据集来自ega-archive.org，包含哮喘、哮喘缓解期与健康受试者支气管活检的RNAseq基因表达数据，用于研究三组间的差异表达
基本信息
资源简介
哮喘、哮喘缓解期与健康受试者支气管活检RNAseq基因表达
Gene expression by RNAseq in bronchial biopsies of asthmatics, asthma in remission and healthy subjects
该数据集来自ega-archive.org，包含哮喘、哮喘缓解期与健康受试者支气管活检的RNAseq基因表达数据，用于研究三组间的差异表达。共184个样本通过QC，数据以221对FASTQ文件形式提供，部分样本关联多次测序运行。样本经TruSeq Stranded Total RNA建库、RiboZero Gold去除rRNA，并在Illumina HiSeq2500上以双端2×100 bp测序。可用于哮喘持续与缓解状态的转录组比较及生物标志物探索（来源 EGA）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该研究的重点是利用RNAseq对持续性哮喘、哮喘缓解期和健康对照者的支气管活检进行差异表达分析。共有184个通过QC的样本。RNA样本使用TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation Kit（Illumina, San Diego, CA）处理，采用Caliper Sciclone NGS Workstation（PerkinElmer, Waltham, MA）上的自动化流程。在此流程中，所有细胞质和线粒体rRNA均被去除（RiboZero Gold kit）。获得的cDNA片段文库以多个样本混合的形式加载到Illumina HiSeq2500测序仪上，使用默认参数进行双端测序（2 × 100 bp）。数据以221对FASTQ文件形式提供。请注意，若干样本关联多次测序运行。
【主题与分类】
主题标签：None。本站分类：呼吸系统疾病/哮喘。
【获取与许可】
源站页面：https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001005112
下载信息
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源站：https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001005112
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
哮喘患者、哮喘缓解期患者和健康受试者支气管活检中通过RNAseq检测的基因表达[数据集]。https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001005112
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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