探索IBD患者粪便钙卫蛋白水平、母婴微生物群、婴儿健康、营养及不良妊娠结局

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07385807

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：IBD（炎症性肠病）、IBD、IBD - 炎症性肠病、妊娠。炎症性肠病（IBD）是一种慢性胃肠道疾病，常在生育年龄期间发病，约有25%的IBD患者在确诊后生育子女。妊娠期IBD可能对婴儿健康产生负面影响，因为IBD患者所生的婴儿往往表现出较高的粪便钙卫蛋白（FCP）水平，这是胃肠道炎症的一个标志物。FCP水平升高与日后患哮喘、湿疹和IBD的风险增加有关。本研究旨在探讨母体肠道微生物组、饮食和母乳成分如何影响婴儿FCP水平，并识别可能指导饮食干预以改善婴儿健康结局的因素。

具体而言，本研究旨在：(1) 识别与婴儿FCP水平升高相关的妊娠期母体肠道微生物群和饮食因素，(2) 确定与高FCP水平相关的婴儿肠道微生物群和饮食因素，(3) 验证一种监督式机器学习模型，该模型能够利用微生物群和饮食数据预测1岁婴儿的高FCP水平，以及(4) 表征患有和不患有IBD的母亲母乳中母乳寡糖（HMO）的组成及其与婴儿肠道微生物群和FCP水平的关联。这项前瞻性研究将评估母体IBD患者（活动期或静止期）和非IBD对照及其婴儿在妊娠期间和产后的微生物群和饮食习惯变化。参与者将在妊娠期间（第1、第2和早第3孕期）招募，并在四个时间点收集数据和样本：第3孕期（第34-35周）、产后2周、产后3个月和产后1年。

收集的数据将包括3天饮食回顾、母婴粪便样本（用于微生物群组成和FCP水平检测）、可选的母乳和乳房皮肤拭子、阴道拭子，以及妊娠和婴儿结局。这些数据将被整合到一个机器学习

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。