S100A8通过激活单核细胞及诱导气道上皮细胞凋亡通路加重儿童哮喘气道炎症的支撑数据
该数据集为儿童哮喘相关研究提供生物信息学分析与标本数据支撑,包含来自GEO数据库的RNA-Seq表达数据集GSE286262(基于GPL2467平台的单细胞RNA测序,涵盖2名健康儿童与2名哮喘儿童的气道上皮细胞)以及GSE40732(基于GPL16025平台,包含97名哮喘儿童与97名健康儿童的气

基本信息
资源简介
S100A8通过激活单核细胞及诱导气道上皮细胞凋亡通路加重儿童哮喘气道炎症的支撑数据
Data supporting the publication: S100A8 exacerbates airway inflammation in childhood asthma by activating monocytes and inducing the apoptotic pathway of airway epithelial cells
该数据集为儿童哮喘相关研究提供生物信息学分析与标本数据支撑,包含来自GEO数据库的RNA-Seq表达数据集GSE286262(基于GPL2467平台的单细胞RNA测序,涵盖2名健康儿童与2名哮喘儿童的气道上皮细胞)以及GSE40732(基于GPL16025平台,包含97名哮喘儿童与97名健康儿童的气道上皮转录组数据)。数据经缺失值去除后分组,表达谱由FPKM转换为TPM。可用于探索S100A8在儿童哮喘气道炎症中的作用机制,涉及单核细胞激活与气道上皮细胞凋亡通路,适用于分类等分析任务(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2026。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):生物信息学分析与标本数据。从公共GEO数据库( Illumina NextSeq 500(Homo sapiens)平台的RNA-Seq表达数据集GSE286262(单细胞RNA测序,scRNA-seq)以及基于GPL16025 NimbleGen Homo sapiens Expression Array [100718_HG18_opt_expr]平台的scRNA表达数据集GSE40732。纳入标准设定如下:(1)样本来自人类基因表达芯片;(2)GSE286262包含来自2名健康儿童和2名哮喘儿童的气道上皮细胞单细胞scRNA-seq数据集,GSE40732包含来自97名哮喘儿童和97名健康儿童的气道上皮转录组数据。去除缺失值后,对所有数据进行分组。表达谱FPKM转换为TPM(transcripts per kilobase)并
【主题与分类】
主题标签:Other Health、Health、Asthma、S100A8、monocytes、airway epithelial cells。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。
【获取与许可】
源站页面:https://data.4tu.nl/datasets/85e34c32-d8ae-422e-a54a-d67adac334ae/1
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.4121/85e34c32-d8ae-422e-a54a-d67adac334ae.v1
标准获取流程:
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
生物信息学分析与样本数据。从公共GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下载了基于GPL2467 Illumina NextSeq 500(Homo sapiens)平台的RNA-Seq表达数据集GSE286262(单细胞RNA测序,scRNA-seq),以及基于GPL16025 NimbleGen Homo sapiens Expression Array [100718_HG18_opt_expr]平台的scRNA表达数据集GSE40732。纳入标准设定如下:(1)样本来自人类基因表达芯片;(2)GSE286262包含来自2名健康儿童和2名哮喘儿童的气道上皮细胞单细胞scRNA-seq数据集,GSE40732包含来自97名哮喘儿童和97名健康儿童的气道上皮转录组数据。去除缺失值后,对所有数据进行分组。表达谱FPKM转换为TPM(每千碱基转录本),并进一步以log2(FPKM + 1)进行分析。
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