基于EGEA研究用无监督方法按哮喘状态表征成人鼻炎
该数据集来自法国EGEA研究，包含983名成人（无哮喘582人、有哮喘401人）的鼻炎相关自报症状与过敏致敏信息，涉及鼻部症状、花粉症、鼻窦炎、结膜炎及对灰尘、动物、干草/花、冷空气等诱因的敏感性，过敏致敏以12种气传过敏原中至少一项皮肤点刺试验阳性定义
基本信息
资源简介
基于EGEA研究用无监督方法按哮喘状态表征成人鼻炎
Characterization of Rhinitis According to the Asthma Status in Adults Using an Unsupervised Approach in the EGEA Study
该数据集来自法国EGEA研究，包含983名成人（无哮喘582人、有哮喘401人）的鼻炎相关自报症状与过敏致敏信息，涉及鼻部症状、花粉症、鼻窦炎、结膜炎及对灰尘、动物、干草/花、冷空气等诱因的敏感性，过敏致敏以12种气传过敏原中至少一项皮肤点刺试验阳性定义。数据用于以混合模型进行无监督聚类，在有无哮喘两组中分别识别成人鼻炎表型，并与经典假设驱动方法比较，可支撑鼻炎表型分类与哮喘相关呼吸系统疾病研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Characterization of Rhinitis According to the Asthma Status in Adults Using an Unsupervised Approach in the EGEA Study》发表于 PLOS ONE（2015），DOI：10.1371/journal.pone.0136191。源站首次发布：2015-08-26。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：背景 流行病学研究中对成人鼻炎的分类尚属缺失。目的 使用无监督方法（数据驱动）识别成人鼻炎表型，并与经典假设驱动方法进行比较。方法 研究纳入法国哮喘遗传与环境流行病学研究（EGEA）的983名成人。使用与鼻炎相关的自报症状，如鼻部症状、花粉症、鼻窦炎、结膜炎以及对不同诱因（灰尘、动物、干草/花、冷空气……）的敏感性。过敏致敏定义为对12种气传过敏原中至少一项皮肤点刺试验阳性。使用混合模型对参与者进行聚类，分别在无哮喘（Asthma-，n = 582）和有哮喘（Asthma+，n = 401）者中独立进行。结果 在两组中均识别出三个聚类：1）聚类A（Asthma-中占55%，Asthma+中占22%）主要为ch
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 3.25 MB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0136191。
【主题与分类】
源站学科分类：Uncategorised。主题标签：Skin prick test、rhinitis.ConclusionThis cluster analysis、hay fever、EGEA Study BackgroundThe classification、symptom、asthma、Skin prick tests。本站分类：呼吸系统疾病/哮喘。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Uncategorised。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Characterization_of_Rhinitis_According_to_the_Asthma_Status_in_Adults_Using_an_Unsupervised_Approach_in_the_EGEA_Study_/1522663
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Burte, Emilie; Bousquet, Jean; Varraso, Raphaëlle; Gormand, Frédéric; Just, Jocelyne; Matran, Régis; et al. (2016). Characterization of Rhinitis According to the Asthma Status in Adults Using an Unsupervised Approach in the EGEA Study. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-03，引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Characterization of Rhinitis According to the Asthma Status in Adults Using an Unsupervised Approach in the EGEA Study
- DOI：10.1371/journal.pone.0136191
- 发布日期：2015-08-26
- 文件数：2 个
- 文件总体积：3.25 MB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Characterization_of_Rhinitis_According_to_the_Asthma_Status_in_Adults_Using_an_Unsupervised_Approach_in_the_EGEA_Study_/1522663
命令行下载
curl -L -o "S1_Fig.eps" "https://ndownloader.figshare.com/files/2227222"
curl -L -o "S1_Supporting_Information.doc" "https://ndownloader.figshare.com/files/2227223"
文件清单
S1_Fig.eps（3.05 MB）S1_Supporting_Information.doc（203.26 KB）
文件总体积 3.25 MB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
背景
流行病学研究中对成人鼻炎的分类尚属空白。目的
采用无监督方法（数据驱动）识别成人鼻炎的表型，并与经典的假设驱动方法进行比较。方法
研究纳入法国哮喘遗传与环境流行病学研究（EGEA）中的983名成人。使用与鼻炎相关的自我报告症状，如鼻部症状、花粉症、鼻窦炎、结膜炎以及对不同诱发因素（灰尘、动物、干草/花卉、冷空气等）的敏感性。过敏性致敏定义为对12种气传过敏原中至少一种皮肤点刺试验阳性。采用混合模型对参与者进行聚类，分别在无哮喘者（Asthma-，n = 582）和哮喘患者（Asthma+，n = 401）中独立进行。
结果
两组均识别出三个聚类：1）聚类A（哮喘阴性组占55%，哮喘阳性组占22%），主要特征为无鼻部症状；2）聚类B（哮喘阴性组占23%，哮喘阳性组占36%），主要特征为全年均有鼻部症状、鼻窦炎以及皮肤点刺试验阳性率低；3）聚类C（哮喘阴性组占22%，哮喘阳性组占42%），主要特征为鼻部症状在春季出现高峰、皮肤点刺试验阳性率高，以及枯草热、过敏性鼻炎和结膜炎的报告率高。多敏化率最高（80%）见于合并哮喘和过敏性鼻炎的参与者。结论
该聚类分析突出了三种鼻炎聚类，其特征与临床医生所熟知的特征相似，但根据过敏致敏情况有所不同，且无论哮喘状态如何均如此。这些聚类可通过少量变量轻松重建。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0136191（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Characterization_of_Rhinitis_According_to_the_Asthma_Status_in_Adults_Using_an_Unsupervised_Approach_in_the_EGEA_Study_/1522663）。
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