RGS4介导的支气管平滑肌细胞表型转换促进哮喘固定性气道阻塞

数据涉及健康者与轻、中、重度哮喘受试者支气管活检中 RGS4 的表达检测,以及人气道平滑肌细胞和人精密切割肺切片的增殖、钙动员与支气管收缩实验,可用于研究重度哮喘气道平滑肌增生与收缩能力下降的机制(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)

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2023-05-31 更新
浏览 16
时间序列分类rgs4-mediatedphenotypicbronchialcellspromotesairwayobstructionasthma
An RGS4-Mediated Phenotypic Switch of Bronchial Smooth Muscle Cells Promotes Fixed Airway Obstruction in Asthma

基本信息

模态
时间序列
大小
0.001382988 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-31
版本
v1

资源简介

RGS4介导的支气管平滑肌细胞表型转换促进哮喘固定性气道阻塞

An RGS4-Mediated Phenotypic Switch of Bronchial Smooth Muscle Cells Promotes Fixed Airway Obstruction in Asthma

该数据集来自 plos.figshare.com,聚焦呼吸系统疾病中的哮喘,围绕 RGS4 介导的支气管平滑肌细胞表型转换与固定性气道阻塞这一主题,包含 4 个文件,样例为 Figure_S1.tif 至 Figure_S4.tif,配套论文发表于 PLoS ONE(2012 年),DOI 为 10.1371/journal.pone.0028504。数据涉及健康者与轻、中、重度哮喘受试者支气管活检中 RGS4 的表达检测,以及人气道平滑肌细胞和人精密切割肺切片的增殖、钙动员与支气管收缩实验,可用于研究重度哮喘气道平滑肌增生与收缩能力下降的机制(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《An RGS4-Mediated Phenotypic Switch of Bronchial Smooth Muscle Cells Promotes Fixed Airway Obstruction in Asthma》发表于 PLoS ONE(2012),DOI:10.1371/journal.pone.0028504。源站首次发布:2012-01-12。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在重度哮喘中,支气管扩张剂和类固醇不敏感的气流阻塞通过未知机制发生,其特征是肺气道平滑肌(ASM)质量和硬度增加。我们探索了 G 蛋白信号调节蛋白(RGS4)在晚期哮喘特征性的 ASM 增生和收缩能力降低中的作用。使用免疫细胞化学染色,在健康受试者以及轻度、中度和重度哮喘受试者的支气管内活检中测定了 RGS4 的 ASM 表达。在培养的人 ASM 细胞和人精密切割肺切片中测定了细胞增殖试验、激动剂诱导的钙动员和支气管收缩。使用功能获得和功能缺失方法,确定了 RGS 蛋白在刺激人 ASM 增殖和抑制支气管收缩中的确切作用。RGS4 表达 wa

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 1.38 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0028504。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Medicine、Molecular Biology、Physiology。主题标签:rgs4-mediated、phenotypic、bronchial、cells、promotes、airway、obstruction、asthma。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Medicine、Molecular Biology、Physiology。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/An_RGS4_Mediated_Phenotypic_Switch_of_Bronchial_Smooth_Muscle_Cells_Promotes_Fixed_Airway_Obstruction_in_Asthma/129688

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Damera, Gautam; M. Druey, Kirk; R. Cooper, Philip; P. Krymskaya, Vera; J. Soberman, Roy; Amrani, Yassine; et al. (2016). An RGS4-Mediated Phenotypic Switch of Bronchial Smooth Muscle Cells Promotes Fixed Airway Obstruction in Asthma. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

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curl -L -o "Figure_S2.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/352618"
curl -L -o "Figure_S3.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/352654"
curl -L -o "Figure_S4.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/352677"

文件清单

  • Figure_S1.tif(452.90 KB)
  • Figure_S2.tif(400.61 KB)
  • Figure_S3.tif(199.73 KB)
  • Figure_S4.tif(329.75 KB)

文件总体积 1.38 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

在重症哮喘中,支气管扩张剂和类固醇不敏感的气流阻塞通过未知机制发展,其特征是肺气道平滑肌(ASM)质量和硬度增加。我们探索了G蛋白信号调节蛋白(RGS4)在晚期哮喘特征的ASM增生和收缩能力降低中的作用。通过免疫细胞化学染色,测定了健康受试者以及轻度、中度和重度哮喘受试者支气管内活检中ASM的RGS4表达。在培养的人ASM细胞和人精密切割肺切片中,测定了细胞增殖试验、激动剂诱导的钙动员和支气管收缩。利用功能获得和丧失的方法,确定了RGS蛋白在刺激人ASM增殖和抑制支气管收缩中的精确作用。RGS4表达限于ASM的一个亚群,并被促分裂原特异性上调,从而诱导出类似于难治性哮喘中观察到的过度增殖和收缩减弱的ASM表型。

重度哮喘患者支气管平滑肌中RGS4表达显著增加,且其表达与肺功能下降显著相关。尽管RGS4抑制G蛋白偶联受体(GPCR)介导的支气管收缩,但出乎意料的是,RGS4是PDGF诱导的增殖和PI3K持续激活所必需的,PI3K是一种调节ASM增殖的促有丝分裂信号分子。这些研究表明,RGS4表达增加促进了ASM的表型转换,导致重度哮喘患者出现不可逆的气道阻塞。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0028504(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/An_RGS4_Mediated_Phenotypic_Switch_of_Bronchial_Smooth_Muscle_Cells_Promotes_Fixed_Airway_Obstruction_in_Asthma/129688)。

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