基于鼻转录组学识别儿童ARDS三种内型的标准输入数据集
该数据集来自NCBI GEO，包含儿童急性呼吸窘迫综合征（ARDS）及对照受试者下鼻甲鼻转录组谱的非扩增样本数据，用于识别儿童ARDS的内型
基本信息
资源简介
基于鼻转录组学识别儿童ARDS三种内型的标准输入数据集
GSE152978 数据集来自 NCBI GEO 数据库，题为“Identification of 3 Endotypes In Pediatric ARDS Using Nasal Transcriptomics-Standard Input”，聚焦呼吸道疾病中的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）。该数据集收录了儿童 ARDS 受试者与对照受试者下鼻甲的鼻转录组谱数据，且为非扩增样本，研究据此识别出三种儿童 ARDS 内型。数据集包含 1 个文件，即 GSE152978_series_matrix.txt.gz，采用高通量测序进行表达谱分析，物种为人（9606），平台编号为 GPL16791，作者为 Brian、Varisco，发布时间为 Jun 22 202。
【数据集背景】
急性呼吸窘迫综合征是呼吸道疾病领域的重要临床问题，儿童 ARDS 的异质性给诊疗带来挑战。该研究以鼻转录组学为切入点，通过对下鼻甲进行转录组谱分析，在儿童 ARDS 受试者与对照受试者之间进行比较，旨在识别儿童 ARDS 的内型。源站描述明确指出，该研究识别出三种儿童 ARDS 内型，说明数据集服务于内型分型这一研究目标。鼻部取样相对无创，下鼻甲转录组谱为观察呼吸道相关表达变化提供了样本来源，这也是该数据集在呼吸道疾病分类下的主要背景。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件，文件样例为 GSE152978_series_matrix.txt.gz，属于系列矩阵文件，通常用于汇总表达谱数据。主题标签显示其属于高通量测序表达谱分析，平台为 GPL16791，物种为人（9606）。源站描述强调该数据针对非扩增标本，即样本未经过扩增处理。数据覆盖儿童 ARDS 受试者与对照受试者下鼻甲的鼻转录组谱，用于支持三种内型的识别。除上述文件与主题信息外，源站未提供更细的样本数量、分组规模或具体基因层面的内容。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI GEO 数据库。研究对象为儿童 ARDS 受试者与对照受试者，采集部位为下鼻甲，检测方式为鼻转录组谱分析，且为非扩增样本。作者为 Brian、Varisco，发布时间为 Jun 22 202。本站将其归类为呼吸道疾病 / 急性呼吸窘迫综合征。除来源站、作者与发布时间外，源站未提供具体的采集机构、伦理审批或临床中心信息。
【适用场景】
该数据集适用于儿童 ARDS 内型识别相关的研究场景，例如基于鼻转录组谱探索三种内型的表达特征，或比较 ARDS 受试者与对照受试者之间的转录组差异。由于样本为非扩增标本，也可用于关注非扩增转录组数据特征的分析。其主题标签表明适用于高通量测序表达谱分析。需要说明的是，源站未提供该数据集在临床诊断、预后预测或其他具体应用中的验证信息，因此不宜将其用途扩展至清单之外的结论。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE152978_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩包格式。建议先按文件格式读取，并在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集仅含 1 个系列矩阵文件，使用时应以该文件为主要数据入口，结合平台编号 GPL16791 与物种信息人（9606）进行注释与解读。源站未提供额外的分析脚本、预处理参数或标准化流程说明。
【质量与限制】
数据集为非扩增标本的鼻转录组谱，样本来源为下鼻甲，研究目标为识别三种儿童 ARDS 内型。其限制在于：文件数量仅为 1 个系列矩阵文件，源站未提供样本量、分组明细、测序深度、质控指标或批次信息；发布时间标注为 Jun 22 202，年份信息不完整；源站未提供数据质量评估结论。因此，使用时应自行核对数据完整性与字段含义，避免超出源站描述进行推断。
【引用与许可】
源站未提供引用格式与许可条款。使用时建议注明数据集名称 GSE152978 及其来源 NCBI GEO，并参考源站标题与作者信息（Brian、Varisco）。关于许可与使用限制，源站未提供，需以 NCBI GEO 页面实际说明为准。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE152978
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究通过对对照组和儿童ARDS受试者下鼻甲的鼻转录组进行分析来识别内型。该数据集针对的是未扩增的样本。该研究识别出三种儿童ARDS内型。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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