母系遗传背景对湖南中部舌癌患者遗传易感性的影响
该数据集是一个包含105名湖南舌癌患者线粒体DNA控制区序列的基因组数据集，通过测序和比对分析记录了突变位点与单倍群信息，并整合了354名健康个体的对照数据，主要用于研究线粒体DNA变异与舌癌遗传易感性之间的关联，为癌症遗传学和分子流行病学领域提供关键数据支持。
基本信息
资源简介
母系遗传背景对湖南中部舌癌患者遗传易感性的影响
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Maternal genetic backgrounds contribute to the genetic susceptibility of tongue cancer patients in Hunan, central of China》。配套论文《Maternal genetic backgrounds contribute to the genetic susceptibility of tongue cancer patients in Hunan, central of China》发表于 Mitochondrial DNA Part A（2017），DOI：10.1080/24701394.2016.1278539。项目资助方：This work was supported by Science and Technology Foundation of Changsha, Hunan province [K1508046-31], Science and Technology Foundation of Health and Family Planning Commission [B2016082], National Natural Science Foundation of China [81260510] and Science and Technology Foundation of Health and Family Planning commission of Hunan province [B2016082].。源站首次发布：2018-03-26。
【数据内容】
源站原始描述：Mitochondrial DNA (mtDNA) mutations played crucial roles on affecting the susceptibility to cancer. In this study, to investigate whether mitochondrial DNA mutations contributed to the genetic susceptibility of Chinese tongue cancer patients, mtDNA control regions of 105 Chinese tongue cancer patients were amplified and sequenced, the mutations were recorded by comparing with the revised Cambridge Reference Sequence (rCRS), which were attributed to certain mtDNA haplogroups based on the specific…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 17.15 KB。imdn_a_1278539_sm1402.xls：application/zip，17.15 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.6026735.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biochemistry、Genetics、Ecology、Biological Sciences not elsewhere classified、Developmental Biology、Cancer。主题标签：Tongue cancer、mtDNA、susceptibility。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry、Genetics、Ecology、Biological Sciences not elsewhere classified、Developmental Biology、Cancer。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Maternal_genetic_backgrounds_contribute_to_the_genetic_susceptibility_of_tongue_cancer_patients_in_Hunan_central_of_China/6026735
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Maternal genetic backgrounds contribute to the genetic susceptibility of tongue cancer patients in Hunan, central of China. Taylor & Francis. Zhou, Hai-Yan; Shu, Hong-Ying; Dai, Jie; Li, Hong-Chao; Tang, Li; Wang, Hua-Wei; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-02-15，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个面向舌癌遗传易感性研究的基因组数据集，主要包含105名湖南中部舌癌患者的线粒体DNA（mtDNA）控制区序列数据。数据通过对患者样本进行扩增和测序获得，并与修订剑桥参考序列（rCRS）比对以记录突变位点，进而根据特异性变异模式将每个患者归入特定的mtDNA单倍群。数据集还纳入了来自相似地理区域的354名健康个体（包括苗族等八个群体）的单倍群频率数据作为对照，通过主成分分析和遗传距离计算，评估舌癌组与对照组的差异。研究发现，在超变序列I（HVSI）区域中，16,124、16,148等13个变异位点以及C、F2*、M10等单倍群在舌癌组与对照组之间存在显著差异，提示线粒体DNA可能在舌癌的母系遗传易感性中发挥关键作用。该数据集适用于癌症遗传学、分子流行病学及线粒体基因组与疾病关联研究。
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