HeLa细胞与A1555G杂交细胞中线粒体12S超甲基化数据集

该数据集来自omicsdi.org,聚焦线粒体12S rRNA超甲基化的转录效应研究。数据涵盖通过过表达线粒体甲基转移酶mtTFB1的HeLa细胞以及12S rRNA呈超甲基化的A1555G杂交细胞,并以过表达甲基转移酶缺陷型mtTFB1(mtTFB1[G65A])的HeLa细胞和野生型A1555A

omicsdi
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基因组预测Transcriptomics
Mitochondrial 12S hypermethylation in HeLa cells and A1555G cybrids

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

HeLa细胞与A1555G杂交细胞中线粒体12S超甲基化数据集

该数据集来自omicsdi.org,聚焦线粒体12S rRNA超甲基化的转录效应研究。数据涵盖通过过表达线粒体甲基转移酶mtTFB1的HeLa细胞以及12S rRNA呈超甲基化的A1555G杂交细胞,并以过表达甲基转移酶缺陷型mtTFB1(mtTFB1[G65A])的HeLa细胞和野生型A1555A杂交细胞作为对照。样本包括四例12S rRNA超甲基化样本(两种细胞系,各两个生物学重复)与四例基础12S rRNA甲基化样本(两种细胞系,各两个生物学重复),可用于转录组学分析及听力损失相关机制研究(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集研究线粒体12S rRNA超甲基化的转录效应,既通过在HeLa细胞中过表达线粒体甲基转移酶mtTFB1,也通过使用12S rRNA呈超甲基化的A1555G杂交细胞。以过表达甲基转移酶缺陷型mtTFB1(mtTFB1[G65A])的HeLa细胞和野生型A1555A杂交细胞作为对照。四例12S rRNA超甲基化样本(两种细胞系,各两个生物学重复)对比四例基础12S rRNA甲基化样本(两种细胞系,各两个生物学重复)。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:耳鼻咽喉疾病/听力损失。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-33780

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-33780

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集研究线粒体12S rRNA高甲基化的转录效应,分别通过在HeLa细胞中过表达线粒体甲基转移酶mtTFB1以及使用12S rRNA呈高甲基化的A1555G胞质杂种细胞来实现。以过表达甲基转移酶缺陷型mtTFB1(mtTFB1[G65A])的HeLa细胞和野生型A1555A胞质杂种细胞作为对照。四份12S rRNA高甲基化样本(两种细胞系,各设两个生物学重复)对比四份基础12S rRNA甲基化样本(两种细胞系,各设两个生物学重复)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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