HeLa细胞与A1555G杂交细胞中线粒体12S超甲基化数据集
该数据集来自omicsdi.org,聚焦线粒体12S rRNA超甲基化的转录效应研究。数据涵盖通过过表达线粒体甲基转移酶mtTFB1的HeLa细胞以及12S rRNA呈超甲基化的A1555G杂交细胞,并以过表达甲基转移酶缺陷型mtTFB1(mtTFB1[G65A])的HeLa细胞和野生型A1555A

基本信息
资源简介
HeLa细胞与A1555G杂交细胞中线粒体12S超甲基化数据集
该数据集来自omicsdi.org,聚焦线粒体12S rRNA超甲基化的转录效应研究。数据涵盖通过过表达线粒体甲基转移酶mtTFB1的HeLa细胞以及12S rRNA呈超甲基化的A1555G杂交细胞,并以过表达甲基转移酶缺陷型mtTFB1(mtTFB1[G65A])的HeLa细胞和野生型A1555A杂交细胞作为对照。样本包括四例12S rRNA超甲基化样本(两种细胞系,各两个生物学重复)与四例基础12S rRNA甲基化样本(两种细胞系,各两个生物学重复),可用于转录组学分析及听力损失相关机制研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集研究线粒体12S rRNA超甲基化的转录效应,既通过在HeLa细胞中过表达线粒体甲基转移酶mtTFB1,也通过使用12S rRNA呈超甲基化的A1555G杂交细胞。以过表达甲基转移酶缺陷型mtTFB1(mtTFB1[G65A])的HeLa细胞和野生型A1555A杂交细胞作为对照。四例12S rRNA超甲基化样本(两种细胞系,各两个生物学重复)对比四例基础12S rRNA甲基化样本(两种细胞系,各两个生物学重复)。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:耳鼻咽喉疾病/听力损失。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-33780
下载信息
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暂未开放公开下载
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-33780
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本数据集研究线粒体12S rRNA高甲基化的转录效应,分别通过在HeLa细胞中过表达线粒体甲基转移酶mtTFB1以及使用12S rRNA呈高甲基化的A1555G胞质杂种细胞来实现。以过表达甲基转移酶缺陷型mtTFB1(mtTFB1[G65A])的HeLa细胞和野生型A1555A胞质杂种细胞作为对照。四份12S rRNA高甲基化样本(两种细胞系,各设两个生物学重复)对比四份基础12S rRNA甲基化样本(两种细胞系,各设两个生物学重复)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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