晚期脊索瘤RNA测序数据
该数据集直接提供晚期脊索瘤转录组测序数据,可用于差异表达、免疫微环境、分子靶点发现和转录组亚型分析。

基本信息
资源简介
晚期脊索瘤RNA测序数据
【一句话概览】
该数据集包含来自7名晚期脊索瘤患者的配对末端批量RNA测序数据,测序在Illumina HiSeq 4000或NovaSeq 6000平台上完成(来源 EGA)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《RNA-seq of chordoma samples》。
【数据内容】
源站原始描述:This dataset contains paired-end bulk RNA-seq data of advanced chordoma samples from 7 patients. Sequencing was performed on Illumina HiSeq 4000 or NovaSeq 6000
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):该数据集包含来自7名晚期脊索瘤患者的配对末端批量RNA测序数据。测序在Illumina HiSeq 4000或NovaSeq 6000平台上进行。
【主题与分类】
主题标签:None。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://ega-archive.org/datasets/EGAD50000001019
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://ega-archive.org/datasets/EGAD50000001019
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含7名晚期脊索瘤患者样本的双端bulk RNA-seq数据。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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