脊索瘤选择性依赖性基因的基因组和转录组特征相关性及线性模型结果
该数据集包含脊索瘤选择性依赖性基因的基因组和转录组特征相关性分析结果，数据模态为基因拷贝数、表达和突变等表格型数据，通过计算Pearson相关系数和线性模型参数，揭示基因依赖性与分子特征之间的关联，主要用于脊索瘤的精准医学研究、功能基因组学分析和潜在治疗靶点的识别。
基本信息
资源简介
脊索瘤选择性依赖性基因的基因组和转录组特征相关性及线性模型结果
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genomic and transcriptomic feature correlations and linear model results for each chordoma-selective dependency gene》。源站首次发布：2022-12-22。
【数据内容】
源站原始描述：An individual table is provided for each dependency gene. Each row represents a dependency–feature pair. dependency: HGNC symbol of dependency; feature_type: type of genomic/transcriptomic feature, i.e., copy number (cn), gene expression (ge), or mutation (mut); feature: name of genomic/transcriptomic feature; feature_rank: rank of genomic/transcriptomic feature, based on absolute correlation with gene dependency; correlation: Pearson correlation coefficient between CERES gene effect for indicat…
【数据结构与技术规格】
文件数 22 个，合计 371.88 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.21774746.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Cancer genetics。主题标签：CRISPR-Cas9 screens、Cancer。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cancer genetics。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Genomic_and_transcriptomic_feature_correlations_and_linear_model_results_for_each_chordoma-selective_dependency_gene/21774746
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Sharifnia, Tanaz (2022). Genomic and transcriptomic feature correlations and linear model results for each chordoma-selective dependency gene. figshare. Dataset
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集针对脊索瘤选择性依赖性基因，提供了基因组与转录组特征的相关性分析及线性模型结果。数据集包含多个表格，每个表格对应一个依赖性基因，每行代表一个依赖性-特征对。主要数据包括依赖性基因的HGNC符号、特征类型（如拷贝数变异、基因表达或突变）、特征名称、特征排名、Pearson相关系数，以及线性模型的斜率估计、标准误、t统计量和P值。数据来源于对脊索瘤细胞的基因依赖性筛选，旨在通过分析基因依赖性与基因组/转录组特征之间的关联，识别与脊索瘤发生发展相关的关键生物标志物和治疗靶点，主要应用于癌症精准医学、功能基因组学和药物靶点发现等研究方向。
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