大规模蛋白质组学区分胆脂瘤与周围组织并鉴定与发病机制相关的新蛋白质
该数据集包含胆脂瘤及周围组织(如鼓膜、外耳道皮肤等)的蛋白质组学数据,通过nanoLC-MS/MS技术鉴定出2400多种蛋白质,并识别出295种差异表达蛋白质,数据模态为蛋白质质谱数据;其主要用途是研究胆脂瘤的发病机制,通过分析蛋白质表达差异和功能聚类,揭示促炎蛋白、蛋白酶和细胞外基质蛋白的异常表达与疾病表型的关联,为靶向治疗研究提供基础。
https://figshare.com/articles/dataset/_Large_Scale_Proteomics_Differentiates_Cholesteatoma_from_Surrounding_Tissues_and_Identifies_Novel_Proteins_Related_to_the_Pathogenesis_/1130416
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资源简介
该数据集是一项大规模蛋白质组学研究,旨在通过蛋白质表达差异分析揭示胆脂瘤(中耳内角化鳞状上皮异常增生)的发病机制。数据集包含五种人体组织类型(胆脂瘤、胆脂瘤颈部、鼓膜、外耳道皮肤和中耳黏膜)的蛋白质组学数据,使用nanoLC-MS/MS技术鉴定出超过2400种独特蛋白质,并识别出295种在胆脂瘤中差异表达的蛋白质。数据通过SRM质谱进行验证,并利用Ingenuity Pathway Analysis进行功能聚类和疾病关联预测。研究发现胆脂瘤中促炎性S100蛋白(如S100A7A和S100A7)和蛋白酶(如ELANE)表达上调,而细胞外基质蛋白(如COL18A1和NID2)表达下调,这些变化可能与组织完整性和分化异常相关。该数据集为胆脂瘤的病理机制研究提供了蛋白质组学基础,有助于识别潜在的治疗靶点。
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