大规模蛋白质组学区分胆脂瘤与周围组织并鉴定与发病机制相关的新蛋白质
该数据集包含胆脂瘤及周围组织（如鼓膜、外耳道皮肤等）的蛋白质组学数据，通过nanoLC-MS/MS技术鉴定出2400多种蛋白质，并识别出295种差异表达蛋白质，数据模态为蛋白质质谱数据；其主要用途是研究胆脂瘤的发病机制，通过分析蛋白质表达差异和功能聚类，揭示促炎蛋白、蛋白酶和细胞外基质蛋白的异常表达与疾病表型的关联，为靶向治疗研究提供基础。
基本信息
资源简介
大规模蛋白质组学区分胆脂瘤与周围组织并鉴定与发病机制相关的新蛋白质
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Large-Scale Proteomics Differentiates Cholesteatoma from Surrounding Tissues and Identifies Novel Proteins Related to the Pathogenesis》。配套论文《Large-Scale Proteomics Differentiates Cholesteatoma from Surrounding Tissues and Identifies Novel Proteins Related to the Pathogenesis》发表于 PLoS ONE（2014），DOI：10.1371/journal.pone.0104103。源站首次发布：2014-08-05。
【数据内容】
源站原始描述：Cholesteatoma is the growth of keratinizing squamous epithelium in the middle ear. It is associated with severe complications and has a poorly understood etiopathogenesis. Here, we present the results from extensive bioinformatics analyses of the first large-scale proteomic investigation of cholesteatoma. The purpose of this study was to take an unbiased approach to identifying alterations in protein expression and in biological processes, in order to explain the characteristic phenotype of this…
【数据结构与技术规格】
文件数 8 个，合计 3.69 MB。Figure_S1.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，1.70 MB。Figure_S2.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，67.03 KB。Figure_S3.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，996.28 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0104103。
【主题与分类】
源站学科分类：Biological Sciences。主题标签：Biochemistry、proteomics、Protein abundance、cell biology、Molecular cell biology、dermatology、Inflammatory diseases、otorhinolaryngology、differentiates、cholesteatoma。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological Sciences。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Large_Scale_Proteomics_Differentiates_Cholesteatoma_from_Surrounding_Tissues_and_Identifies_Novel_Proteins_Related_to_the_Pathogenesis_/1130416
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Britze, Anders; Isak Dupont Birkler, Rune; Gregersen, Niels; Ovesen, Therese; Palmfeldt, Johan (2016). Large-Scale Proteomics Differentiates Cholesteatoma from Surrounding Tissues and Identifies Novel Proteins Related to the Pathogenesis. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-03，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集是一项大规模蛋白质组学研究，旨在通过蛋白质表达差异分析揭示胆脂瘤（中耳内角化鳞状上皮异常增生）的发病机制。数据集包含五种人体组织类型（胆脂瘤、胆脂瘤颈部、鼓膜、外耳道皮肤和中耳黏膜）的蛋白质组学数据，使用nanoLC-MS/MS技术鉴定出超过2400种独特蛋白质，并识别出295种在胆脂瘤中差异表达的蛋白质。数据通过SRM质谱进行验证，并利用Ingenuity Pathway Analysis进行功能聚类和疾病关联预测。研究发现胆脂瘤中促炎性S100蛋白（如S100A7A和S100A7）和蛋白酶（如ELANE）表达上调，而细胞外基质蛋白（如COL18A1和NID2）表达下调，这些变化可能与组织完整性和分化异常相关。该数据集为胆脂瘤的病理机制研究提供了蛋白质组学基础，有助于识别潜在的治疗靶点。
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