AERD 15-脂氧合酶通路单细胞数据
该数据集直接服务于阿司匹林加重性呼吸道疾病机制研究,可用于细胞类型注释、炎症通路分析、药物反应标志物发现和AERD/CRSwNP分类。

基本信息
资源简介
AERD 15-脂氧合酶通路单细胞数据
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Establishment of Transposase-assisted Low-input m6A Sequencing Technique》。源站首次发布:Feb 23 202。
【数据内容】
源站原始描述:As the most abundant and best-characterized internal mRNA modification, N6-methyladenosine (m6A) emerges to play a critical regulatory role in wide range of physiological and pathological processes, including gametogenesis, neuronal development, obesity and tumorigenesis. Methylated RNA immunoprecipitation coupled with next-generation sequencing (MeRIP-seq) facilitates transcriptome-wide m6A profiling, also is the most widely used technique to understand the biological significance of m6A. Howev…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Other、GPL20795、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167307
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 09 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167307
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
比较AERD和CRSwNP鼻息肉细胞的单细胞转录组数据,关注花生四烯酸代谢通路。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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