基本信息

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创建/更新时间

2026-10-08

资源简介

phs000935：儿科基因组测序应用（PediSeq）

phs000935: Applying Genomic Sequencing in Pediatrics (PediSeq) 是一个来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 研究数据集，其英文全称为 Applying Genomic Sequencing in Pediatrics (PediSeq)。该数据集在分类上归属于耳鼻咽喉疾病下的腺样体扁桃体疾病方向，主题标签为 Cross-Sectional 与 Longitudinal，源站将其描述为横断面、纵向研究。基于这些信息，该数据集可用于围绕儿科基因组测序应用开展横断面与纵向分析，并支撑耳鼻咽喉及腺样体扁桃体疾病相关研究。整体而言，它面向儿科基因组测序应用这一主题，兼具横断面与纵向研究属性，适合在儿科与耳鼻咽喉相关疾病研究背景下进行进一步的数据探索与分析利用。

【数据集背景】

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 研究，英文名称为 phs000935: Applying Genomic Sequencing in Pediatrics (PediSeq)。从名称可以看出，其核心关注点是将基因组测序应用于儿科领域。源站将其研究类型描述为横断面、纵向研究，说明该数据集在时间维度上同时具备横断面观察与纵向追踪的特征。在分类体系中，该数据集被归入耳鼻咽喉疾病下的腺样体扁桃体疾病方向，因此其研究背景与儿科基因组测序应用以及耳鼻咽喉、腺样体扁桃体相关疾病存在关联。关于该数据集更具体的立项背景、研究动机与目标，源站未提供。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Cross-Sectional 与 Longitudinal，表明其内容组织与横断面、纵向研究设计相关。源站将其描述为横断面、纵向研究，可用于围绕儿科基因组测序应用开展横断面与纵向分析，并支撑耳鼻咽喉及腺样体扁桃体疾病相关研究。关于数据集所包含的具体变量、样本量、测序类型、临床指标、随访时间点等详细内容，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 dbGaP 研究。其英文名称为 phs000935: Applying Genomic Sequencing in Pediatrics (PediSeq)。源站描述其为横断面、纵向研究。关于具体的采集方式、采集地点、采集时间、纳入与排除标准、样本处理流程等信息，源站未提供。

【适用场景】

依据源站描述，该数据集可用于围绕儿科基因组测序应用开展横断面与纵向分析，并支撑耳鼻咽喉及腺样体扁桃体疾病相关研究。其主题标签 Cross-Sectional 与 Longitudinal 也提示，该数据集适合用于需要同时考虑横断面比较与纵向变化的研究场景。在分类上，它归属于耳鼻咽喉疾病 / 腺样体扁桃体疾病，因此可服务于该领域的相关分析需求。关于更具体的适用场景、分析类型或研究问题，源站未提供。

【使用方法】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 研究，英文名称为 phs000935: Applying Genomic Sequencing in Pediatrics (PediSeq)。关于该数据集的具体使用方法、访问流程、下载方式、数据处理步骤、分析工具或操作指南，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集被源站描述为横断面、纵向研究，主题标签为 Cross-Sectional 与 Longitudinal。关于该数据集的质量评价、数据完整性、偏倚风险、样本代表性、缺失情况以及其他使用限制，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 研究，英文名称为 phs000935: Applying Genomic Sequencing in Pediatrics (PediSeq)。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用协议或数据共享规定，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000935

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000935

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Cross-Sectional, Longitudinal).

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别