NextGen联盟:iPSCORE(用于组学研究的人诱导多能干细胞资源)

数据覆盖对照集、家系与双生子样本,主题标签包括 Control Set、Family、Twin。可用于组学研究相关的对照比较、家系与双生子设计分析等场景

dbgap
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基因组Control Set, Family, Twin
phs000924: NextGen Consortium: The iPSCORE (iPSC Collection for Omic Research) Resource

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

NextGen联盟:iPSCORE(用于组学研究的人诱导多能干细胞资源)

phs000924 是 NextGen Consortium 框架下的 iPSCORE(iPSC Collection for Omic Research)资源,属于 NCBI dbGaP 收录的研究数据集。该数据集围绕对照集、家系与双生子三类样本组织,主题标签涵盖 Control Set、Family 与 Twin,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。在站内分类中,它被归入耳鼻咽喉疾病 / 腺样体扁桃体疾病方向。整体来看,这一资源以组学研究为背景,提供可用于对照比较、家系分析与双生子设计分析的数据基础,适合关注遗传与组学层面研究设计的人员参考使用。

【数据集背景】

该数据集英文全称为 phs000924: NextGen Consortium: The iPSCORE (iPSC Collection for Omic Research) Resource,属于 NextGen Consortium 相关资源的一部分。其收录于 NCBI 的 dbGaP 平台,dbGaP 是面向基因型与表型关联研究的公开数据库。数据集在站内被划入耳鼻咽喉疾病 / 腺样体扁桃体疾病分类,说明其应用方向与这一疾病领域存在关联。数据集的主题标签包括 Control Set、Family 与 Twin,反映出其样本组织方式围绕对照、家系和双生子展开。源站对其的描述为 dbGaP study (Control Set, Family, Twin),进一步明确了该研究在样本类型上的基本定位。

【数据内容】

数据内容覆盖对照集、家系与双生子样本三类。对照集用于提供比较基线,家系样本支持家族内遗传关系分析,双生子样本则可用于区分遗传与环境因素影响的研究设计。主题标签 Control Set、Family、Twin 与上述样本类型相对应。关于具体的样本数量、组学层次、检测平台、变量字段等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 收录的研究项目。源站描述其为 dbGaP study,样本类型涉及 Control Set、Family 与 Twin。关于采集地点、采集时间、招募方式、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

基于其对照集、家系与双生子样本结构,该数据集可用于组学研究相关的对照比较、家系与双生子设计分析等场景。在耳鼻咽喉疾病 / 腺样体扁桃体疾病分类下,可服务于该领域内涉及遗传与组学层面的研究设计。关于具体可支持的分析方法、统计模型或疾病表型范围,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 NCBI dbGaP 平台发布,通常需遵循 dbGaP 的数据访问流程获取。关于具体的下载方式、访问权限层级、所需申请材料及分析工具建议,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 dbGaP 收录研究,样本类型涵盖对照集、家系与双生子。关于样本量、数据完整性、质控指标、批次效应、人群代表性等质量相关信息,源站未提供。使用时应结合 dbGaP 平台对该研究的访问与使用规定。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP study。关于具体的引用格式、许可条款、数据使用协议及授权要求,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000924

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Control Set, Family, Twin).

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