GSE293637:形式追随功能:核形态作为细胞衰老的可量化预测指标

该数据集来自 NCBI GEO,标题为“形式追随功能:核形态作为细胞衰老的可量化预测指标”,包含 1 个文件(GSE293637_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及高通量测序表达谱、GPL24676 平台和 9606(人)

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基因组分类GPL246769606
GSE293637: Form follows function: Nuclear morphology as a quantifiable predictor of cellular senescence

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

GSE293637:形式追随功能:核形态作为细胞衰老的可量化预测指标

Form follows function: Nuclear morphology as a quantifiable predictor of cellular senescence

该数据集来自 NCBI GEO,标题为“形式追随功能:核形态作为细胞衰老的可量化预测指标”,包含 1 个文件(GSE293637_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及高通量测序表达谱、GPL24676 平台和 9606(人)。源站描述指出,衰老细胞常出现核增大或形态不规则,近期研究显示核形态可作为衰老的预测性生物标志物,并可通过深度学习算法分析核形态,在多种细胞类型和物种、体外与体内实现增殖细胞与衰老细胞的准确分类。该数据可用于研究核形态与衰老负担及临床数据的关联,辅助理解年龄相关疾病及疾病预后与治疗(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 02 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在经历衰老的组织细胞中,常可观察到细胞核增大或形状不规则。然而,这种特殊形态是衰老的原因还是结果,以及它在区分增殖细胞与衰老细胞方面具有多大信息量,此前仍不清楚。近期研究表明,核形态可作为衰老的预测性生物标志物,提示细胞核在驱动衰老表型中发挥主动作用。通过采用深度学习算法分析核形态,可在多种细胞类型和物种中、在体外和体内实现将细胞准确分类为增殖性或衰老性。这种基于定量成像的方法可用于建立衰老负担与临床数据之间的联系,有助于理解年龄相关疾病,并协助疾病预后和治疗。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:耳鼻咽喉疾病/腺样体扁桃体疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE293637

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 22 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE293637

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在衰老的组织细胞中,常可观察到细胞核增大或形状不规则。然而,这种特殊形态究竟是衰老的原因还是结果,以及它在区分增殖细胞与衰老细胞方面具有多大信息价值,仍不清楚。近期研究表明,细胞核形态可作为衰老的预测性生物标志物,提示细胞核在驱动衰老表型中发挥主动作用。通过采用深度学习算法分析细胞核形态,可在体外和体内多种细胞类型和物种中实现将细胞准确分类为增殖性或衰老性。这种基于定量成像的方法可用于建立衰老负荷与临床数据之间的联系,有助于理解年龄相关疾病,并辅助疾病预后和治疗反应评估。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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