干眼患者泪液及眼表NLRP3炎症小体上调数据
该数据集来自干眼患者泪液及眼表NLRP3炎症小体表达研究,包含54例Sjögren综合征干眼患者、50例非Sjögren综合征干眼患者和46例健康对照

基本信息
资源简介
干眼患者泪液及眼表NLRP3炎症小体上调数据
Data from: Upregulation of NLRP3 inflammasome in the tears and ocular surface of dry eye patients
该数据集来自干眼患者泪液及眼表NLRP3炎症小体表达研究,包含54例Sjögren综合征干眼患者、50例非Sjögren综合征干眼患者和46例健康对照。研究检测了泪膜破裂时间、Schirmer I试验和荧光素染色,并通过ELISA分析泪液IL-1β和IL-18水平,通过结膜印迹细胞学标本的定量RT-PCR检测NLRP3、caspase-1、IL-1β和IL-18的mRNA表达,以及Western blotting检测NLRP3和caspase-1蛋白表达。该数据可用于干眼炎症机制研究及生物标志物分析(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2015。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:评估人干眼中NLRP3炎症小体及其下游炎症因子的mRNA和蛋白表达。方法:我们招募了54例Sjögren综合征干眼(SSDE)患者、50例非Sjögren综合征干眼(NSSDE)患者和46例健康对照。对所有受试者进行泪膜破裂时间(TBUT)、Schirmer I试验和荧光素染色(FL)。获取泪液样本,通过酶联免疫吸附(ELISA)分析IL-1β和IL-18的炎症细胞因子水平。收集结膜印迹细胞学(CIC)标本,使用定量RT-PCR检测NLRP3、caspase-1、IL-1β和IL-18的mRNA表达,并通过Western blotting检测NLRP3和caspase-1的蛋白表达。结果:与对照组相比,两个干眼组的NLRP3 mRNA表达均显示更高水平,具有相对显著的升高
【主题与分类】
主题标签:Human disease、ophthalmolgy、IL-18、ocular surface、NLRP3 inflammasome、Dry Eye Patients、IL-1β、dry eye、caspase-1、2013-2015。本站分类:症状、体征与临床所见。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.7vn28
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.7vn28
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- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 283.6 KB。
数据说明
目的:评估人干眼中NLRP3炎症小体及其下游炎症因子的mRNA和蛋白表达。方法:我们招募了54例干燥综合征干眼(SSDE)患者、50例非干燥综合征干眼(NSSDE)患者和46例健康对照者。对所有受试者进行泪膜破裂时间(TBUT)、Schirmer I试验和荧光素染色(FL)检查。采集泪液样本,通过酶联免疫吸附(ELISA)分析IL-1β和IL-18的炎症细胞因子水平。采集结膜印迹细胞学(CIC)标本,使用定量RT-PCR检测NLRP3、caspase-1、IL-1β和IL-18的mRNA表达,并通过Western blotting检测NLRP3和caspase-1的蛋白表达。结果:与对照组相比,两个干眼组的NLRP3 mRNA表达水平均较高,其中SSDE组的升高程度相当显著(相对上调2.47倍,p<0.05)。与对照组相比,SSDE组的NLRP3蛋白表达也增加(相对上调1.94倍)。
caspase-1的mRNA表达在SSDE(相对上调1.44倍,p<0.05)和NSSDE(相对上调1.32倍,p<0.05)中均显著上调。与对照组相比,procaspase-1蛋白水平在SSDE(相对上调1.84倍)和NSSDE(相对上调1.12倍)中升高;与对照组相比,caspase-1蛋白表达在SSDE(相对上调1.49倍)和NSSDE(相对上调1.17倍)中也升高。SSDE和NSSDE患者的IL-1β和IL-18 mRNA值及蛋白表达均高于对照组。与对照组相比,IL-1β的相对mRNA表达在SSDE中上调3.59倍(p<0.001),在NSSDE中上调2.13倍(p<0.01)。IL-1β蛋白水平在SSDE中也显示显著上调(p=0.01;与对照组相比)。IL-18 mRNA表达水平在SSDE中显著上调(相对2.97倍
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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