分析微阵列(GSE45006)大鼠T8脊髓损伤7天后 - 补充表1

该数据集包含大鼠T8脊髓损伤模型在损伤后7天的转录组微阵列数据,具体包括4个假手术对照样本和4个损伤样本的基因表达谱,数据模态为基因表达矩阵,主要用于研究脊髓损伤后的分子机制、应激反应相关的基因表达变化,以及潜在治疗靶点的发现。

Mendeley Data
2024-03-27 更新
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脊髓损伤基因表达分析

基本信息

创建/更新时间
2024-03-27

资源简介

该数据集是一个转录组微阵列分析数据集,来源于大鼠T8脊髓损伤模型。数据包含4个假手术(对照)T8脊髓节段和4个损伤后7天的T8脊髓节段的基因表达谱。数据通过基因表达综合数据库(GEO)公开可访问,编号为GSE45006。该数据集由Chamankhah M等人于2013年发表,用于研究脊髓钳夹压缩损伤模型中的应激反应。主要应用于脊髓损伤机制研究、基因表达变化分析和生物标志物发现等方向。

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https://data.mendeley.com/datasets/c6d2hbm4tj

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数据说明

该数据集是一个转录组微阵列分析数据集,来源于大鼠T8脊髓损伤模型。数据包含4个假手术(对照)T8脊髓节段和4个损伤后7天的T8脊髓节段的基因表达谱。数据通过基因表达综合数据库(GEO)公开可访问,编号为GSE45006。该数据集由Chamankhah M等人于2013年发表,用于研究脊髓钳夹压缩损伤模型中的应激反应。主要应用于脊髓损伤机制研究、基因表达变化分析和生物标志物发现等方向。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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