银行田鼠朊蛋白168-176片段QYNNQNNFV
该数据集包含银行田鼠朊蛋白168-176位氨基酸片段(QYNNQNNFV)的三维结构数据,属于蛋白质结构模态,通过X射线衍射方法在1.1埃分辨率下测定,主要用于朊蛋白原纤维的亚埃级结构解析、神经退行性疾病(如朊病毒病)的分子机制研究,以及蛋白质错误折叠相关病理过程的探索。

基本信息
资源简介
银行田鼠朊蛋白168-176片段QYNNQNNFV
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Segment from bank vole prion protein 168-176 QYNNQNNFV》。
【数据内容】
源站原始描述:polar clasp, amyloid fibril, prion, PROTEIN FIBRIL
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:10.1038/s41594-017-0018-0。
【主题与分类】
主题标签:PROTEIN FIBRIL。
【获取与许可】
源站页面:https://www.rcsb.org/structure/6BTK
规范引用:Sub-angstrom cryo-EM structure of a prion protofibril reveals a polar clasp. (2018) Nat. Struct. Mol. Biol
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://pdbj.org/mine/summary/6btk
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是银行田鼠朊蛋白(prion protein)中第168至176位氨基酸残基(序列为QYNNQNNFV)的结构数据,来源于蛋白质数据库(PDB)。数据通过X射线衍射方法在1.1埃分辨率下测定,由Glynn、Rodriguez、Boyer和Gallagher-Jones等作者于2017年12月提交,2018年1月发布,并于2024年3月更新。数据集包含朊蛋白原纤维的亚埃级冷冻电镜结构,揭示了极性扣合特征,主要应用于朊蛋白结构解析、神经退行性疾病(如朊病毒病)的分子机制研究,以及蛋白质错误折叠相关疾病的药物靶点探索。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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