PRION降解组基础图谱
PRION降解组基础图谱 是真实公开或可申请访问的数据资源，包含表格数据、临床变量、标签或随访信息。该数据集适合朊病毒病相关的CJD/朊病毒病文本抽取、分子机制、快速进展性痴呆鉴别和临床表型筛选，也便于复现基准实验、训练模型和开展跨队列验证。
基本信息
资源简介
PRION降解组基础图谱
【数据集背景】
本数据集源站标题为《PRION Degradome Foundation Atlas》。源站首次发布：2025-10-27。
【数据内容】
源站原始描述：This open-access dataset presents Version 1 of the Prion Degradome Foundation Atlas, a curated proteolytic peptide resource designed to advance translational research in prion biology and this devastating neurodegenerative disease. The atlas integrates proteolytic fragments derived from the human prion protein (PrP), encompassing wild-type (PrPC) and pathogenic isoforms (PrPSc) associated with heriditary spongiform encephalopathies. By systematically mapping and annotating these cleavage product…
文件 prion-cleavage.py 为文本内容，开头为：from collections import deque sequence = ''MANLGCWMLVLFVATWSDLGLCKKRPKPGGWNTGGSRYPGQGSPGGNRYPPQGGGGWGQPHGGGWGQPHGGGWGQPHGGGWGQPHGGGWGQGGGTHSQWNKPSKPKTNMKHMAGAAA…
文件 properties-prion.py 为文本内容，开头为：import pandas as pd import peptides data = pd.read_csv(''prion.csv'') mz_values = [] weight_values = [] boman_values = [] charge_values = [] ip_values = [] h…
【数据结构与技术规格】
文件数 5 个，合计 1.16 MB。PRION-Atlas-v1.tar.xz：application/x-xz，1.15 MB。prion-cleavage.py：text/x-script.python，1.61 KB。properties-prion.py：text/plain，3.16 KB。数据集 DOI：10.5522/04/30455555.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biochemistry and cell biology not elsewhere classified、Proteomics and metabolomics、Other chemical sciences not elsewhere classified、Computational chemistry、Applied mathematics not elsewhere classified、Other health sciences not elsewhere classified。主题标签：PRION、Creutzfeldt–Jakob disease (CJD)、mad cow disease、Prion Disease Biomarker Research、prion degradation、P04156。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://rdr.ucl.ac.uk/articles/dataset/PRION_Degradome_Foundation_Atlas/30455555
使用许可：CC0（https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/）。
规范引用：Petzold, Axel (2025). PRION Degradome Foundation Atlas. University College London. Dataset
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://rdr.ucl.ac.uk/articles/dataset/PRION_Degradome_Foundation_Atlas/30455555
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
PRION降解组基础图谱 提供朊病毒相关蛋白降解组图谱数据，用于分子机制研究，可用于朊病毒病相关研究中的CJD/朊病毒病文本抽取、分子机制、快速进展性痴呆鉴别和临床表型筛选。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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