散发性CJD脑神经炎症表达数据

散发性CJD脑神经炎症表达数据 是真实公开或可申请访问的数据资源,包含表格数据、临床变量、标签或随访信息。该数据集适合朊病毒病相关的CJD/朊病毒病文本抽取、分子机制、快速进展性痴呆鉴别和临床表型筛选,也便于复现基准实验、训练模型和开展跨队列验证。

GEO submittersGEO submitters
NCBI GEO
2021-01-08 更新
浏览 34
表格分类Expression profiling by arrayGPL293119606
GSE160208 sCJD Neuroinflammation

基本信息

模态
表格
大小
0.000485478 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2021-01-08

资源简介

散发性CJD脑神经炎症表达数据

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Gene expression in the brain of sporadic Creutzfeldt-Jakob disease patients (CJD), and normal controls (CT)》。源站首次发布:Oct 27 202。

【数据内容】

源站原始描述:Neuroinflammation is an essential part of neurodegeneration. Yet, current understanding of neuroinflamma-tion associated molecular events in distinct brain regions of prion disease patients is insufficient to lay the ground for effective treatment strategies targeting this complex neuropathological process. To address this problem, we analyzed expression of 800 neuroinflammation associated genes to create a profile of biological processes taking place in frontal cortex and cerebellum of patients…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL29311、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE160208

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 19 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE160208

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

散发性CJD脑神经炎症表达数据 提供 CJD 患者额叶和小脑神经炎症相关基因表达数据,可用于朊病毒病相关研究中的CJD/朊病毒病文本抽取、分子机制、快速进展性痴呆鉴别和临床表型筛选。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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