UK Biobank:50万参与者影像与基因组队列

本数据集为神经系统疾病领域的医学影像公开数据集,来源:ukbiobank。

ukbiobank
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医学影像cohortgenomicsimagingEHRpopulation
UK Biobank: 500,000 Participant Cohort with Imaging and Genomics

基本信息

模态
医学影像
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

UK Biobank:50万参与者影像与基因组队列

UK Biobank: 500,000 Participant Cohort with Imaging and Genomics 是一个以约 50 万名英国参与者为基础的大型深度表型队列资源,汇集基因组、影像、检验、电子病历与生活方式数据,并以约 30,000 个可检索字段构成公开字段浏览体系。本站将其归入“神经系统疾病 / 其他”分类。

【数据集背景】

该数据集来自 UK Biobank,来源站为 biobank.ndph.ox.ac.uk。源站将其描述为全球最大深度表型队列之一,强调 50 万英国参与者的深度表型、影像和基因分型信息。其主题标签包括 cohort、genomics、imaging、EHR、population,说明它同时具有人群队列、基因组学、影像学、电子病历和人群研究属性。除这些背景信息外,源站未提供更详细的建库历史、组织架构或项目沿革说明。

【数据内容】

数据内容覆盖多个维度:基因组数据;影像数据,包括脑、心、腹 MRI、眼底和 DXA;检验数据;电子病历数据;以及生活方式数据。源站说明 Data Showcase 公开字段浏览器可检索全部约 30,000 个字段。主题标签进一步标明队列、基因组、影像、电子病历和人群等方向。关于各数据模块的具体变量、时间跨度、样本量分层、随访安排等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 biobank.ndph.ox.ac.uk,参与人群为 50 万英国参与者。源站将其定位为深度表型队列,涵盖基因组、影像、检验、电子病历和生活方式数据。采集方式、招募流程、伦理审批、数据更新周期等细节,源站未提供。

【适用场景】

从主题标签与源站描述看,该数据集适用于需要大规模人群队列、基因组、影像、电子病历和生活方式数据的分析场景。本站分类为神经系统疾病 / 其他。更细化的应用方向、疾病终点定义、统计功效评估等,源站未提供。

【使用方法】

可通过来源站 biobank.ndph.ox.ac.uk 的 Data Showcase 公开字段浏览器检索全部约 30,000 个字段。除该公开字段浏览入口外,申请流程、访问层级、下载方式、分析环境等,源站未提供。

【质量与限制】

源站称其为全球最大深度表型队列之一,并给出 50 万参与者、约 30,000 个可检索字段等规模信息。关于数据质量、缺失率、人群代表性、偏倚、版本更新、隐私限制和访问限制等,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://biobank.ndph.ox.ac.uk/showcase

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

全球最大深度表型队列之一:50 万英国参与者的基因组、影像(脑/心/腹 MRI、眼底、DXA)、检验、电子病历与生活方式数据。Data Showcase 公开字段浏览器可检索全部 ~30,000 字段。500k participants with deep phenotyping, imaging and genotyping.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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