蝌蚪脑双光子显微成像数据集

主题标签:神经系统疾病、双光子显微成像、蝌蚪脑、神经生理、NWB标准、BRAIN Initiative。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,主题涵盖神经系统疾病。

dandi
2026-08-28 更新
浏览 9
医学影像神经系统疾病双光子显微成像蝌蚪脑神经生理NWB标准BRAIN Initiative
Two-photon microscopy of tadpole brains

基本信息

模态
医学影像
创建/更新时间
2026-08-28
版本
draft

资源简介

蝌蚪脑双光子显微成像数据集

Two-photon microscopy of tadpole brains 是一个公开的神经生理学数据集,收录于 DANDI Archive,编号为 dandiset 001957。该数据集以 NWB 标准组织数据,属于 BRAIN Initiative 相关数据资源,联系人为 Akbari, Najva。从主题上看,它涉及神经系统疾病、双光子显微成像、蝌蚪脑以及神经生理等方向,本站将其归入神经系统疾病 / 其他类别。整体而言,该数据集面向神经系统疾病领域的公开数据共享需求,围绕蝌蚪脑的双光子显微成像与神经生理记录展开,适合关注神经环路活动、显微成像与标准化神经数据的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集来自 dandiarchive.org,是 DANDI Archive 中的 dandiset 001957。DANDI Archive 是面向神经生理数据的公开存档平台,该数据集采用 NWB 标准,并与 BRAIN Initiative 相关联。其主题标签包括神经系统疾病、双光子显微成像、蝌蚪脑、神经生理、NWB 标准以及 BRAIN Initiative。数据集被本站归入神经系统疾病 / 其他分类,说明其应用领域与神经系统疾病研究相关。联系人为 Akbari, Najva。除上述信息外,源站未提供更多关于研究背景、立项动机或所属项目的说明。

【数据内容】

该数据集的核心内容是蝌蚪脑的双光子显微成像数据,属于神经生理学数据范畴,并采用 NWB 标准进行组织。主题涵盖神经系统疾病。数据以 NWB 标准格式存储,这一格式通常用于神经生理及相关实验数据的标准化描述与共享。关于数据的具体规模、包含的受试个体数量、成像视野、时间跨度、神经元数量、信号类型或具体实验条件,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 dandiarchive.org 上的 DANDI Archive,数据集编号为 dandiset 001957。采集方式涉及双光子显微成像,研究对象为蝌蚪脑。该数据集与 BRAIN Initiative 相关,并遵循 NWB 标准。联系人为 Akbari, Najva。关于具体的采集设备、显微镜型号、成像参数、实验地点、采集时间以及样本制备方法,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于神经系统疾病领域的公开数据使用,尤其适合围绕蝌蚪脑双光子显微成像与神经生理信号开展的分析、方法验证或数据复用。由于采用 NWB 标准,它可用于支持标准化神经数据的处理流程、工具测试以及跨数据集比较等通用场景。主题标签中的神经系统疾病提示其可能用于相关疾病模型或机制研究的数据参考。关于该数据集是否适用于特定疾病、特定脑区或特定行为范式,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 NWB 标准格式提供,可通过 DANDI Archive 获取,数据集编号为 dandiset 001957。使用者可按照 DANDI Archive 的常规访问方式检索和下载该数据集,并利用支持 NWB 标准的工具进行读取与处理。联系人为 Akbari, Najva,如需进一步了解数据细节,可通过源站提供的联系方式进行咨询。关于具体的下载步骤、访问权限、所需软件版本或处理示例,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 DANDI Archive 上的公开数据集,采用 NWB 标准,并与 BRAIN Initiative 相关。其主题涵盖神经系统疾病、双光子显微成像、蝌蚪脑与神经生理。关于数据质量评估、缺失情况、噪声水平、标注完整性、可重复性验证以及使用限制,源站未提供。使用者应结合自身研究目的,参考源站的最新说明进行判断。

【引用与许可】

该数据集来自 dandiarchive.org 的 DANDI Archive,编号为 dandiset 001957,联系人为 Akbari, Najva。关于具体的引用格式、许可条款、使用协议或版权归属,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应以源站发布的信息为准。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001957

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001957. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Akbari, Najva.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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