截短型stathmin-2是额颞叶痴呆TDP-43病理的标志物

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE153960

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

额颞叶痴呆（FTD）是早发性痴呆中第二常见的类型，目前尚无治疗方法，但正在研究针对与FTD病理亚型相关的两种主要蛋白——TDP-43（FTLD-TDP）和tau（FTLD-tau）——的治疗药物。由于我们无法区分FTLD-TDP和FTLD-tau患者，在临床试验中测试潜在疗法受到阻碍。因此，鉴于有报道称TDP-43功能障碍导致截短型STMN2蓄积，我们评估了截短型stathmin-2（STMN2）作为TDP-43病理的替代标志物。截短型STMN2在TDP-43耗竭的人诱导多能干细胞来源的神经元中蓄积，但在无TDP-43聚集或核蛋白丢失的情况下携带致病性TARDBP突变的神经元中则不然。在对NYGC ALS队列人脑样本的RNA-Seq分析中，截短型STMN2 RNA仅限于以TDP-43包涵体为特征的组织和疾病亚型。最后，我们验证了截短型STMN2 RNA在FTLD-TDP患者队列的额叶皮层中升高，而在对照组或进行性核上性麻痹（一种FTLD-tau）患者中则未升高。

此外，在FTLD-TDP患者中，我们观察到截短的STMN2 RNA与磷酸化TDP-43水平及更早的发病年龄存在显著关联。总体而言，我们的数据揭示了截短的STMN2可作为FTD中TDP-43功能障碍的标志物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。