链脲佐菌素糖尿病雄性Wistar大鼠糖尿病前8周背根神经节糖尿病神经病变转录谱分析

该数据集来自ebi.ac.uk,收录链脲佐菌素诱导的糖尿病雄性Wistar大鼠在糖尿病前8周内背根神经节的转录谱分析数据,采用微阵列技术检测基因表达变化

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基因组分类transcription profiling by arrayRattus norvegicus
Transcription profiling of diabetic neuropathy in dorsal root ganglia from streptozotocin-diabetic male wistar rats over the first 8 weeks of diabetes

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

链脲佐菌素糖尿病雄性Wistar大鼠糖尿病前8周背根神经节糖尿病神经病变转录谱分析

该数据集围绕链脲佐菌素诱导的糖尿病雄性Wistar大鼠模型,对糖尿病发病后前8周内背根神经节的转录谱进行系统分析,采用微阵列技术检测基因表达变化,属于神经系统疾病领域中与糖尿病周围神经病变相关的研究数据。数据集英文名称明确指向“糖尿病神经病变背根神经节转录谱分析”,主题标签涵盖转录谱分析、微阵列与褐家鼠(Rattus norvegicus),来源站为ebi.ac.uk。整体而言,该数据集为研究糖尿病早期背根神经节基因表达动态提供了转录组层面的实验记录,适合关注糖尿病神经病变分子机制的研究者参考使用。

【数据集背景】

糖尿病神经病变是糖尿病常见的并发症之一,累及周围神经系统,背根神经节作为感觉神经元的胞体所在部位,在神经病变发生发展中具有重要地位。该数据集针对链脲佐菌素诱导的糖尿病雄性Wistar大鼠模型,聚焦糖尿病发病后的前8周这一时间窗口,旨在通过转录谱分析刻画背根神经节在糖尿病早期的基因表达变化。源站描述指出,这是一项关于链脲佐菌素诱导糖尿病雄性Wistar大鼠背根神经节糖尿病神经病变的研究,时间跨度覆盖糖尿病最初8周。

【数据内容】

数据集的主题标签为“transcription profiling by array”和“Rattus norvegicus”,表明其数据内容属于基于微阵列的转录谱分析,物种为褐家鼠。数据所反映的是背根神经节组织在糖尿病前8周内的基因表达变化信息。除上述内容外,关于具体样本数量、阵列平台型号、探针数量、差异表达基因列表等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于ebi.ac.uk。实验对象为链脲佐菌素诱导的糖尿病雄性Wistar大鼠,取材组织为背根神经节,观察时间范围为糖尿病发病后的前8周。源站描述与数据集英文名称均一致指向这一实验设计。关于具体的诱导剂量、动物饲养条件、样本采集流程、RNA提取与杂交实验步骤等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与实验设计,该数据集可适用于糖尿病神经病变相关的基础研究场景,例如探讨糖尿病早期背根神经节中基因表达谱的改变、寻找与周围神经病变相关的候选基因或通路、以及作为同类动物模型转录组研究的参照数据。由于数据覆盖糖尿病最初8周,适合关注疾病早期分子事件的研究者使用。关于该数据集在其他具体研究中的验证性应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以微阵列转录谱分析为主题,使用者可按照转录谱数据的常规分析思路,对背根神经节的基因表达数据进行差异表达分析、功能富集分析或时间进程比较等。关于数据文件的具体格式、预处理方式、归一化方法以及配套分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于链脲佐菌素诱导的糖尿病雄性Wistar大鼠模型,物种与性别单一,时间范围限定于糖尿病前8周,这些设计特征构成其适用范围的基本边界。关于样本量大小、技术重复情况、数据质控指标、缺失值处理以及潜在批次效应等信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为ebi.ac.uk。关于数据集的引用方式、作者信息、发表文献以及使用许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-MEXP-515

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Leanne Wardleworth;Andrew Hayes;Sally Price;David Tomlinson;Leo Zeef(2006)。链脲佐菌素诱导的糖尿病雄性Wistar大鼠糖尿病最初8周背根神经节中糖尿病神经病变的转录谱分析[数据集]。https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-MEXP-515

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