SNr 中 Tonic GABA 突触传递电生理记录

主题标签:神经系统疾病、电生理记录、GABA 突触传递、SNr、NWB 标准、BRAIN Initiative。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,主题涵盖神经系统疾病。

dandi
2024-05-22 更新
浏览 12
其他神经系统疾病电生理记录GABA 突触传递SNrNWB 标准BRAIN Initiative
Tonic GABA Synaptic Transmission in SNr Electrophysiology recordings

基本信息

模态
其他
创建/更新时间
2024-05-22
版本
draft

资源简介

SNr 中 Tonic GABA 突触传递电生理记录

Tonic GABA Synaptic Transmission in SNr Electrophysiology recordings 是一个公开的神经电生理数据集,收录于 DANDI Archive,编号为 dandiset 001036。该数据集围绕神经系统疾病这一主题组织,采用 NWB(Neurodata Without Borders)标准格式存储神经生理学记录,属于 BRAIN Initiative 相关数据资源。从主题标签看,其内容涉及电生理记录、GABA 突触传递以及 SNr(黑质网状部)等关键词,联系人为 Simmons 与 DeNard。整体而言,该数据集面向神经科学尤其是神经系统疾病方向的研究者,提供以标准化格式发布的电生理记录,便于检索、复用与跨研究比较。

【数据集背景】

该数据集归属于神经系统疾病这一大类,在分类上被列为“其他”。其主题标签同时包含神经系统疾病、电生理记录、GABA 突触传递、SNr、NWB 标准与 BRAIN Initiative,说明其研究背景与神经系统的电生理活动及抑制性突触传递相关。GABA 是中枢神经系统中主要的抑制性神经递质,SNr 即黑质网状部,是基底节输出通路的重要核团,常与运动调控及相关神经系统疾病的研究相联系。数据集以 NWB 标准发布,符合 BRAIN Initiative 推动数据共享与标准化的方向。关于该数据集更具体的研究动机、科学问题与实验假设,源站未提供。

【数据内容】

数据集英文名称为 Tonic GABA Synaptic Transmission in SNr Electrophysiology recordings,表明其内容为 SNr 区域与紧张性 GABA 突触传递相关的电生理记录。数据以 NWB 标准神经生理学数据集的形态存在,属于 DANDI Archive 上的 dandiset 001036。主题标签涵盖神经系统疾病、电生理记录、GABA 突触传递、SNr、NWB 标准与 BRAIN Initiative。关于记录的具体物种、样本数量、通道数、记录时长、电极类型、刺激范式以及是否包含行为或元数据字段等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 dandiarchive.org,是 DANDI Archive 上编号 001036 的 dandiset,被描述为 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。联系人信息为 Simmons 与 DeNard。关于采集地点、采集设备、实验动物或受试者信息、伦理审批、采集时间范围以及具体实验流程,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与格式,该数据集可服务于神经系统疾病领域的神经电生理研究,尤其是涉及 SNr 与 GABA 能突触传递的分析工作。由于采用 NWB 标准,它适合用于标准化数据处理流程、跨数据集比较以及电生理数据的复用与再分析。同时,作为 BRAIN Initiative 相关资源,也可用于数据共享与协作研究场景。关于该数据集是否适用于特定疾病模型、特定分析软件或特定统计方法,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 NWB 标准格式发布,托管于 DANDI Archive,编号为 dandiset 001036。使用者可通过 DANDI Archive 获取该数据集。关于具体的下载方式、访问权限、所需工具链、数据组织目录结构以及推荐的分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 DANDI Archive 上的公开数据集,采用 NWB 标准,属于 BRAIN Initiative 相关资源。关于数据质量评估、缺失情况、噪声水平、标注完整性、样本量是否充分以及已知技术限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的联系人为 Simmons 与 DeNard,来源站为 dandiarchive.org,编号为 dandiset 001036。关于具体的引用格式、DOI、许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001036

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001036. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Simmons, DeNard.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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