test_release_openscope 神经生理数据集

该数据集采用 NWB 标准组织神经生理学数据,属于 BRAIN Initiative 相关数据资源。从主题上看,其内容涵盖神经系统疾病方向,本站将其归类为神经系统疾病下的“其他”类别

dandi
2021-10-22 更新
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其他神经系统疾病神经生理NWBDANDI ArchiveBRAIN Initiative
test_release_openscope

基本信息

模态
其他
创建/更新时间
2021-10-22
版本
draft

资源简介

test_release_openscope 神经生理数据集

test_release_openscope 是一个面向神经系统疾病领域的公开数据集,收录于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 中的 dandiset 000150。该数据集采用 NWB 标准组织神经生理学数据,属于 BRAIN Initiative 相关数据资源。从主题上看,其内容涵盖神经系统疾病方向,本站将其归类为神经系统疾病下的“其他”类别。数据集以英文名称 test_release_openscope 对外发布,使用者可通过来源站点获取。整体而言,这是一个以神经生理学记录为核心、遵循 NWB 标准、面向神经系统疾病研究的公开数据集,适合对该领域数据感兴趣的研究人员进一步查阅与使用。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集来源于 DANDI Archive,编号为 dandiset 000150,属于 BRAIN Initiative 相关数据资源。DANDI Archive 是面向神经科学数据的公开归档平台,本数据集即在该平台上发布。其主题方向为神经系统疾病,本站将其归入神经系统疾病分类下的“其他”子类。数据集采用 NWB 标准,这一标准常用于神经生理学数据的组织与共享。关于该数据集的具体研究项目背景、资助信息及发起机构等,源站未提供。

【数据内容】

该数据集为 NWB 标准的神经生理学数据集,主题涵盖神经系统疾病。其英文名称为 test_release_openscope。关于数据的具体模态、通道数量、记录时长、受试对象种类与数量、实验任务设计、数据文件规模与格式细节等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 的 dandiset 000150。源站描述其为 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。关于具体的采集设备、采集参数、实验地点、采集时间范围以及数据处理流程等,源站未提供。

【适用场景】

基于其神经系统疾病主题与 NWB 标准的神经生理学数据属性,该数据集可面向神经系统疾病相关的神经生理学研究场景。由于采用 NWB 标准,理论上便于使用支持该标准的数据分析工具进行读取与处理。关于该数据集具体支持的科研问题、推荐的分析方法或已验证的应用案例,源站未提供。

【使用方法】

该数据集发布在 dandiarchive.org,可通过该来源站点获取,对应编号为 dandiset 000150。使用者可依据 DANDI Archive 平台的一般访问方式查阅与下载数据。关于具体的下载步骤、所需工具、依赖环境、数据加载示例及访问权限要求等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NWB 标准的神经生理学数据集,主题为神经系统疾病。关于数据质量评估、标注完整性、缺失情况、潜在偏差以及使用时的注意事项等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 的 dandiset 000150。关于具体的引用格式、作者列表、许可协议及使用条款等,源站未提供。

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下载信息

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/000150

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 000150. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: , .

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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