小鼠局灶性颞叶癫痫海马亚区细胞间突触重组单核转录组分析

该数据集来自 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,属于神经系统疾病分类。数据对应一项单核转录组分析研究,聚焦小鼠局灶性颞叶癫痫模型中海马亚区特异性的细胞间突触重组

omicsdi
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基因组分类Genomics
Single-nucleus transcriptomic analysis reveals subfield-specific cell-to-cell synaptic reorganisation of the mouse hippocampus in focal temporal lobe epilepsy

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-29

资源简介

小鼠局灶性颞叶癫痫海马亚区细胞间突触重组单核转录组分析

该数据集英文名称为 Single-nucleus transcriptomic analysis reveals subfield-specific cell-to-cell synaptic reorganisation of the mouse hippocampus in focal temporal lobe epilepsy,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,在分类上归属于神经系统疾病下的其他类别。从名称与主题可以看出,这是一项围绕小鼠海马展开的单核转录组研究,研究对象是局灶性颞叶癫痫模型,核心关注点在于海马不同亚区之间细胞与细胞之间突触连接的重组特征。数据集以转录组学数据为主体,服务于神经科学与基因组学交叉领域的研究需求,适合关注癫痫发病机制、海马环路重塑以及单细胞分辨率表达谱的研究者参考使用。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面作进一步说明。

【数据集背景】

颞叶癫痫是局灶性癫痫中常见的类型,海马是其关键受累结构。海马在解剖上可划分为多个亚区,各亚区在细胞组成与突触连接上存在差异,这些差异在癫痫发生过程中可能表现出亚区特异性的改变。该数据集对应的研究以小鼠局灶性颞叶癫痫模型为对象,采用单核转录组分析手段,考察海马亚区特异性的细胞间突触重组,试图在单核分辨率下刻画神经元与非神经元群体的表达特征及其与突触组织相关的分子变化。这一背景信息来自数据集名称与源站描述所表达的研究主题。

【数据内容】

数据集的主题标签为 Genomics,表明其内容属于基因组学范畴,具体为单核转录组分析所产生的数据。研究聚焦小鼠海马,强调亚区特异性与细胞间突触重组两个维度,因此数据在组织方式上应围绕海马不同亚区的单核表达谱展开。关于样本数量、测序平台、基因数目、细胞核数量、文件格式与数据规模等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集收录于 omicsdi.org,来源站即为 omicsdi.org。源站描述与数据集英文名称一致,均指向同一项关于小鼠海马单核转录组与局灶性颞叶癫痫的研究。关于样本采集的具体流程、动物模型构建细节、测序机构与数据处理管线等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与分类,该数据集可用于神经系统疾病特别是颞叶癫痫相关的研究场景,例如探讨海马亚区在癫痫条件下的转录组差异、分析细胞间突触组织相关基因的表达变化,以及作为单核转录组分析方法在神经疾病模型中应用的参考数据。也可用于基因组学与神经科学交叉的教学与方法学比较。关于具体可复现的分析任务与验证结论,源站未提供。

【使用方法】

数据集以 Genomics 为主题标签,使用者可按单核转录组数据的常规分析思路进行探索,如下载后开展表达谱质控、亚区与细胞群体比较等。关于数据的具体下载方式、文件组织、配套元数据字段与分析脚本,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 omicsdi.org,其质量信息如测序深度、重复数、批次效应评估等,源站未提供。使用时应注意到数据集对应的是小鼠局灶性颞叶癫痫模型,结论向其他物种或临床场景的外推需谨慎。关于数据的已知局限性说明,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。使用者在引用与再分发前应向来源站核实相关规定。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA1510530

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Single-nucleus transcriptomic analysis reveals subfield-specific cell-to-cell synaptic reorganisation of the mouse hippocampus in focal temporal lobe epilepsy

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