C9orf72 敲除小鼠模型海马与额叶皮层的单核多组学图谱

该数据集包含野生型、杂合及 C9orf72 敲除小鼠海马与额叶皮层组织的单核多组学测序数据,利用 10x Genomics Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression 平台在单个细胞核内同时测量基因表达与染色质可及性,并在 Illumin

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Single-nucleus multiomic profiling of hippocampus and frontal cortex in a C9orf72 knockout mouse model

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-29

资源简介

C9orf72 敲除小鼠模型海马与额叶皮层的单核多组学图谱

该数据集包含野生型、杂合及 C9orf72 敲除小鼠海马与额叶皮层组织的单核多组学测序数据,利用 10x Genomics Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression 平台在单个细胞核内同时测量基因表达与染色质可及性,并在 Illumina NovaSeq 6000 平台测序。数据可用于研究 C9orf72 功能降低或缺失相关的细胞类型特异性分子与调控改变,服务于肌萎缩侧索硬化(ALS)与额颞叶痴呆(FTD)相关脑区研究(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本项目包含从野生型、杂合和 C9orf72 敲除小鼠采集的海马与额叶皮层组织生成的单核多组学测序数据。单核转录组与染色质可及性图谱使用 10x Genomics Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression 平台生成,以在单个细胞核内同时测量基因表达与染色质可及性。该数据集旨在研究与 C9orf72 功能降低或缺失相关的、在肌萎缩侧索硬化(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)相关脑区中的细胞类型特异性分子与调控改变。文库针对配对基因表达与染色质可及性测定制备,并在 Illumina NovaSeq 6000 平台测序。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE333807

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目包含从野生型、杂合子和C9orf72敲除小鼠的海马体和额叶皮层组织采集的单核多组学测序数据。利用10x Genomics Chromium单细胞Multiome ATAC +基因表达平台,同时测量单个细胞核内的基因表达和染色质可及性,生成了单核转录组和染色质可及性图谱。该数据集旨在研究与肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)相关脑区中C9orf72功能降低或缺失相关的细胞类型特异性分子和调控改变。为配对基因表达和染色质可及性检测制备了文库,并在Illumina NovaSeq 6000平台上进行了测序。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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