C9orf72 敲除小鼠模型海马与额叶皮层的单核多组学图谱
该数据集包含野生型、杂合及 C9orf72 敲除小鼠海马与额叶皮层组织的单核多组学测序数据,利用 10x Genomics Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression 平台在单个细胞核内同时测量基因表达与染色质可及性,并在 Illumin

基本信息
资源简介
C9orf72 敲除小鼠模型海马与额叶皮层的单核多组学图谱
该数据集包含野生型、杂合及 C9orf72 敲除小鼠海马与额叶皮层组织的单核多组学测序数据,利用 10x Genomics Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression 平台在单个细胞核内同时测量基因表达与染色质可及性,并在 Illumina NovaSeq 6000 平台测序。数据可用于研究 C9orf72 功能降低或缺失相关的细胞类型特异性分子与调控改变,服务于肌萎缩侧索硬化(ALS)与额颞叶痴呆(FTD)相关脑区研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本项目包含从野生型、杂合和 C9orf72 敲除小鼠采集的海马与额叶皮层组织生成的单核多组学测序数据。单核转录组与染色质可及性图谱使用 10x Genomics Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression 平台生成,以在单个细胞核内同时测量基因表达与染色质可及性。该数据集旨在研究与 C9orf72 功能降低或缺失相关的、在肌萎缩侧索硬化(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)相关脑区中的细胞类型特异性分子与调控改变。文库针对配对基因表达与染色质可及性测定制备,并在 Illumina NovaSeq 6000 平台测序。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE333807
下载信息
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数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE333807
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目包含从野生型、杂合子和C9orf72敲除小鼠的海马体和额叶皮层组织采集的单核多组学测序数据。利用10x Genomics Chromium单细胞Multiome ATAC +基因表达平台,同时测量单个细胞核内的基因表达和染色质可及性,生成了单核转录组和染色质可及性图谱。该数据集旨在研究与肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)相关脑区中C9orf72功能降低或缺失相关的细胞类型特异性分子和调控改变。为配对基因表达和染色质可及性检测制备了文库,并在Illumina NovaSeq 6000平台上进行了测序。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




