脆性X综合征与对照细胞系iNeuron的单细胞短读长和长读长RNA测序
批量样本加入ERCC和SIRV spike-in对照以评估转录本定量准确性，每种条件测序三个生物学重复。数据可用于比较不同测序平台在神经元模型中的转录本检测与定量表现，并支持脆性X综合征相关转录组研究（来源 BioStudies）
基本信息
资源简介
脆性X综合征与对照细胞系iNeuron的单细胞短读长和长读长RNA测序
Single cell short- and long-read RNA-sequencing of iNeurons in Fragile-X and control cell-lines
该数据集来自ebi.ac.uk，包含脆性X综合征（FXS）及对照细胞系来源的NGN2诱导神经元（iNeuron）的批量与单细胞RNA测序数据，采用Illumina短读长以及Pacific Biosciences和Oxford Nanopore Technologies长读长平台，单细胞文库基于10x Genomics Chromium制备。批量样本加入ERCC和SIRV spike-in对照以评估转录本定量准确性，每种条件测序三个生物学重复。数据可用于比较不同测序平台在神经元模型中的转录本检测与定量表现，并支持脆性X综合征相关转录组研究（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本研究在脆性X综合征的人神经元模型中基准测试批量和单细胞长读长RNA测序技术。NGN2诱导的神经元由携带沉默FMR1基因的患者来源iPSC（FXS系E3）和FMR1表达恢复的同基因CRISPR校正拯救系（IsoB11）生成。这些条件提供了一个明确的系统来评估跨测序平台的转录本检测和定量。批量和单细胞RNA-seq数据集使用Illumina短读长测序以及来自Pacific Biosciences（PB）和Oxford Nanopore Technologies（ONT）的长读长测序生成。单细胞文库使用10x Genomics Chromium平台制备。将ERCC和SIRV spike-in对照加入批量样本，以实现转录本定量准确性的基准测试。每种条件测序三个生物学重复。T
【主题与分类】
主题标签：RNA-seq of coding RNA from single cells、Homo sapiens。本站分类：神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-16805
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- OpenDataLab:
数据说明
E-MTAB-16805 脆性X综合征与对照细胞系中iNeurons的单细胞短读长和长读长RNA测序 单细胞编码RNA的RNA-seq EFO EFO_0005684 智人 本研究在脆性X综合征的人类神经元模型中对bulk和单细胞长读长RNA测序技术进行了基准测试
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