帕金森状态下控制与锥体束神经元兴奋性降低时的小鼠初级运动皮层模拟活动

主题标签:神经系统疾病、帕金森病、初级运动皮层、锥体束神经元、神经生理学、NWB、DANDI。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,主题涵盖神经系统疾病。

dandi
2025-05-11 更新
浏览 6
其他预测神经系统疾病帕金森病初级运动皮层锥体束神经元神经生理学NWBDANDI
Simulated mouse primary motor cortex activity during control and decreased pyramidal tract neuron excitability in the parkinsonian condition

基本信息

模态
其他
任务类型
预测
创建/更新时间
2025-05-11
版本
0.250805.2002

资源简介

帕金森状态下控制与锥体束神经元兴奋性降低时的小鼠初级运动皮层模拟活动

该数据集为神经系统疾病领域的公开神经生理学数据集,英文名称为“Simulated mouse primary motor cortex activity during control and decreased pyramidal tract neuron excitability in the parkinsonian condition”,来源于DANDI Archive,对应dandiset编号001444。数据集以NWB标准组织神经生理学数据,属于BRAIN Initiative相关数据资源,联系人为Doherty, Donald。其主题涵盖神经系统疾病,并具体涉及帕金森病、初级运动皮层、锥体束神经元、神经生理学、NWB与DANDI等标签。整体而言,该数据集面向帕金森病条件下初级运动皮层活动的研究,包含对照状态与锥体束神经元兴奋性降低状态下的模拟小鼠神经活动数据,适合用于神经生理学分析、疾病机制探索及相关计算方法验证。

【数据集背景】

该数据集所属领域为神经系统疾病,本站分类归入“神经系统疾病 / 其他”。从主题标签看,其研究背景与帕金森病相关,关注初级运动皮层以及锥体束神经元。帕金森病是一种典型的神经系统疾病,运动皮层及其下行投射神经元的功能改变常被纳入相关机制研究。该数据集以“control”和“decreased pyramidal tract neuron excitability in the parkinsonian condition”为关键条件,说明其设计目的在于对比正常对照状态与帕金森病条件下锥体束神经元兴奋性降低状态之间的神经活动差异。数据集来源为DANDI Archive,源站描述指出其为NWB-standard neurophysiology dataset,并属于BRAIN Initiative。联系人信息为Doherty, Donald。除上述内容外,源站未提供更详细的背景说明。

【数据内容】

数据集英文名称明确指向“Simulated mouse primary motor cortex activity”,即在对照状态与帕金森病条件下锥体束神经元兴奋性降低状态下的模拟小鼠初级运动皮层活动。数据以NWB标准进行组织,属于神经生理学数据。主题标签包括神经系统疾病、帕金森病、初级运动皮层、锥体束神经元、神经生理学、NWB、DANDI。由此可知,数据内容围绕小鼠初级运动皮层的神经活动展开,并涉及锥体束神经元兴奋性变化这一变量。数据中应包含对照条件与兴奋性降低条件两类状态,但具体记录通道数、采样率、神经元数量、时间长度、文件数量、数据规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于dandiarchive.org,对应DANDI Archive dandiset 001444。源站描述其为NWB-standard neurophysiology dataset,并标注为BRAIN Initiative相关资源。联系人信息为Doherty, Donald。数据集为公开数据集,本站分类为神经系统疾病 / 其他。除来源站、编号、标准格式、所属计划及联系人外,源站未提供具体的实验动物品系、手术方法、记录设备、电极类型、采集软件、伦理审批信息或原始实验室等采集细节。

【适用场景】

该数据集适用于神经系统疾病领域的研究,尤其是帕金森病相关的初级运动皮层活动分析。由于数据涉及对照状态与锥体束神经元兴奋性降低状态,可用于比较不同条件下神经活动的变化,也可用于神经生理学数据解析、NWB格式数据读取与处理流程验证、以及相关计算模型的测试。主题标签中的NWB与DANDI表明其适合在DANDI生态中使用,并可与支持NWB的工具链配合。具体适用场景如疾病机制研究、运动皮层编码分析、锥体束神经元功能研究等,源站未提供更明确的推荐用途。

【使用方法】

该数据集以NWB标准存储,可通过支持NWB格式的工具进行读取和处理。由于来源为DANDI Archive,通常可经由DANDI平台访问和下载。联系人信息为Doherty, Donald,如需进一步了解数据使用方式,可参考源站提供的联系渠道。除NWB标准与DANDI来源外,源站未提供具体的下载步骤、API示例、依赖软件版本、数据处理代码或分析流程说明。

【质量与限制】

该数据集为NWB-standard neurophysiology dataset,并属于BRAIN Initiative,说明其在数据组织上遵循一定标准。数据集名称中标注为“Simulated”,提示其数据为模拟产生,而非完全来自真实动物记录。其研究条件限定为对照状态与帕金森病条件下锥体束神经元兴奋性降低状态,主题集中于小鼠初级运动皮层。关于数据质量、噪声水平、验证方式、样本量、可重复性、已知偏差或使用限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于DANDI Archive,dandiset编号为001444,联系人为Doherty, Donald。源站描述中标注为BRAIN Initiative相关资源。关于具体引用格式、作者列表、版本号、DOI、许可协议类型或使用条款,源站未提供。

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源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001444

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001444. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Doherty, Donald.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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